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为探究 2019 - 2023 年呼吸道合胞病毒(RSV)遗传变化,研究人员对缅甸 RSV 进行分子流行病学监测。研究分析 1127 例样本,发现疫情期间 RSV 流行特征改变,且 RSV - A 和 RSV - B 进化速率不同。该研究为防控 RSV 提供重要依据。
呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是导致婴幼儿严重下呼吸道感染的主要病原体,在全球范围内,尤其在低收入和中等收入国家,给儿童健康带来沉重负担。RSV 可分为 RSV - A 和 RSV - B 两个抗原亚组,其 G 基因高度可变,传统的基因分型方法存在标准化不足的问题。此外,2020 年开始的 COVID - 19 大流行对 RSV 的流行产生了直接或间接影响,改变了其爆发规模和季节性模式 。因此,探究 RSV 的传播动态、遗传变异以及 COVID - 19 大流行对其的影响至关重要。
日本新潟大学的研究人员开展了一项针对缅甸 2019 - 2023 年 RSV 感染的分子流行病学监测研究。研究结果发表在《Scientific Reports》上,为理解 RSV 的传播、进化规律以及防控策略提供了重要依据。
研究人员采用了多种关键技术方法:首先,从缅甸仰光两家门诊的急性呼吸道感染儿科患者处收集鼻拭子样本;接着,利用快速诊断测试(RDT)和实时聚合酶链反应(RT - PCR)对样本进行筛选和亚型鉴定;之后,对 RSV 阳性样本的 G 基因胞外区进行测序;最后,运用贝叶斯马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法进行系统发育和分子进化分析。
临床特征:研究期间共收集 1127 例鼻拭子样本,444 例 RDT 检测呈 RSV 阳性,其中 337 例经 RT - PCR 确认。患者中位年龄为 1.0 岁,男性感染率(56.7%)高于女性(42.4%),RSV - B 感染(69.1%)多于 RSV - A 感染(30.9%)。常见症状为咳嗽(92.9%)、流涕(84.0%)等,2023 年 RSV - B 感染患者中出现呼吸困难症状的比例较高(28.6%)。
流行曲线:2019 年,RSV 流行发生在 7 - 11 月,8 - 10 月达到高峰;2020 年无明显流行;2021 年流行发生在 11 - 12 月,且均为 RSV - A 感染;2022 年流行规模较小;2023 年出现最大规模流行,主要由 RSV - B 引起,7 - 10 月流行,8 月达到高峰。
病毒谱系和进化速率:对部分样本的 G 基因胞外区测序后发现,RSV - A 主要为 A.D.3(GA2.3.5)谱系,RSV - B 在 2019 年和 2023 年分别为 B.D.4.1.1(GB5.0.5a)和 B.D.E.1(GB5.0.5a)谱系。通过系统发育树分析,RSV 在缅甸存在全球和本地传播的群体。缅甸 RSV - A 和 RSV - B 的 G 基因胞外区进化速率分别为 7.76×10-3和 5.67×10-3替换 / 位点 / 年。
研究结论显示,2019 - 2023 年缅甸 RSV 的流行、亚型和谱系存在显著变化。COVID - 19 大流行期间的防控措施对 RSV 的发病率产生了重要影响,疫情期间 RSV 感染率降低,而防控措施放松后出现反弹,即 “RSV 免疫债” 现象。同时,研究还发现 RSV - A 和 RSV - B 在缅甸的存活模式不同,且存在独特的氨基酸替换,表明病毒在持续进化。此外,研究估计的 G 基因胞外区进化速率与疫情前其他国家的报道无显著差异,但仍需进一步研究确定影响进化速率的因素。
该研究的意义在于揭示了缅甸 RSV 的流行规律和遗传特征,强调了 COVID - 19 大流行对 RSV 流行病学的影响,为制定 RSV 防控策略提供了科学依据。不过,研究也存在一定局限性,如样本仅来自仰光,无法代表全国情况;仅进行了定性检测,未分析病毒载量;仅关注 G 基因胞外区,未进行全基因组分析。未来研究可通过扩大样本范围、开展全基因组测序等方式,进一步深入了解 RSV 的分子流行病学特征,为防控 RSV 感染、引入疫苗等干预措施提供更有力的支持。