玉米条纹病毒 A 株系病毒粒子链基因的可检测正向选择在宿主适应中的关键作用

为探究玉米条纹病毒（MSV）基因在外界刺激下的分子适应性，研究人员对 A 株系 MSV（MSV-A）的 cp 和 mp 基因开展选择研究。结果发现这两个基因存在位点及分支的正向选择，该结果揭示正向选择在 MSV-A 宿主适应性进化中起重要作用。

　　玉米条纹病毒（Maize streak virus，MSV）有四个基因：cp（编码外壳蛋白）、mp（编码运动蛋白），以及 repA 和 rep（通过可变剪接转录本编码两种不同的复制相关蛋白）。这些基因在病毒的衣壳化、运动、复制以及与外部环境的相互作用中发挥作用，因此容易受到刺激驱动的分子适应性影响。研究人员对公开的、经过整理且无重组的 A 株系玉米条纹病毒（MSV-A）的 cp 和 mp 基因的完整编码序列进行选择研究。发现这两个 MSV 基因在特定基因位点存在全基因选择的证据（cp 为 1.23%，mp 为 0.99%）。正向选择位点的氨基酸 60% 具有亲水性，40% 具有疏水性。在代表南非 MSV-A 株系多样性的分支上（cp 为 0.76%，mp 为 1.66%）发现了显著的正向选择证据，该株系与 MSV-A-matA 分离株（GenBank 登录号：AF329881）相关，在撒哈拉以南非洲地区广泛传播并适应玉米植株。在 mp 基因中，针对 MSV-A 序列的整体多样性以及与 MSV-Mat-A 分离株更相关的序列，选择作用显著增强。这些发现表明，尽管主要经历非多样化选择，但在这些基因中检测到的多样化正向选择可能在 MSV-A 宿主适应性进化中发挥重要作用，确保病毒在不杀死宿主的情况下具有足够的致病性以进行传播。