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为解决东南亚(SEA)地区葡萄膜黑色素瘤(UM)缺乏分子预后工具、难以准确预测转移风险和进行生存预测的问题,研究人员开展了对 SEA 地区 UM 患者染色体畸变的研究。结果发现 SEA 与西方 UM 患者存在显著遗传差异,该研究为 UM 的诊疗提供了新方向。
在眼科疾病的研究领域中,葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma,UM)是一种较为特殊的眼部肿瘤。它的发病率在全球不同地区差异很大,在北欧一些国家发病率较高,而在亚洲国家则相对罕见。这种差异不仅体现在发病率上,在患者的生存情况方面也有所不同,亚洲患者的生存率往往高于西方人群。然而,目前在亚洲,尤其是东南亚地区,针对 UM 的研究却面临诸多困境。一方面,该地区缺乏有效的分子预后工具,临床医生难以准确地对患者进行转移风险评估和生存预测,只能主要依赖临床病理风险因素来判断病情,这显然无法满足精准医疗的需求。另一方面,现有的一些检测技术,如核型分析和荧光原位杂交(FISH),虽然在检测某些染色体异常(如 3 号染色体单体)方面有一定作用,但它们对样本要求较高,通常需要新鲜组织,这在实际临床应用中受到很大限制,严重阻碍了对 UM 的深入研究和有效治疗。为了解决这些问题,新加坡相关研究机构的研究人员开展了一项回顾性队列研究。该研究旨在深入探究东南亚地区 UM 患者的染色体畸变情况,评估这些畸变对临床结果的影响,并与 The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库中的 UM 数据进行对比,挖掘亚洲和西方 UM 患者潜在的遗传差异。这项研究成果发表在《Eye and Vision》杂志上,为 UM 的研究和治疗提供了新的思路和方向。
研究人员主要采用了以下几种关键技术方法:首先,收集 2004 年至 2018 年新加坡国立眼科中心(Singapore National Eye Center,SNEC)的 UM 患者福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-Fixed Paraffin-Embedded,FFPE)的肿瘤样本,这些样本均在治疗前和首次诊断时获取。然后,运用 OncoScan CNV Array 技术检测染色体畸变,通过该技术可以全面地分析全基因组拷贝数变异和拷贝中性杂合性缺失(Copy-Neutral Loss of Heterozygosity,CN-LOH)。同时,对所有样本进行 BAP1 免疫组化(Immunohistochemistry,IHC)检测,以评估 BAP1 蛋白的表达情况。最后,从 TCGA-UM 数据集中提取相关数据进行对比分析。
研究结果如下:
- 患者基本信息和肿瘤特征:研究队列中大部分患者为华裔(75%),男性略多于女性(65% vs 35%),平均诊断年龄为 57±17 岁,呈现出双峰年龄分布,30% 的患者在 35 岁(范围:30 - 45 岁)左右确诊,70% 的患者在 66 岁(范围:52 - 77 岁)左右确诊。肿瘤多位于赤道后(75%),多数为 T3 和 T4 期肿瘤(65%),组织学类型以梭形 B 细胞肿瘤(40%)为主。
- 转移情况:20 例患者中有 4 例发生转移,转移患者以华裔、Fitzpatrick 皮肤量表 III 级为主,女性稍多。转移部位包括肝脏、肺和肾脏,其中肝脏是最常见的转移部位。肿瘤位置、大小、年龄、种族、病理肿瘤(pT)分类、美国癌症联合委员会(American Joint Commission on Cancer,AJCC)分期和肿瘤组织学类型等因素对转移风险无显著影响。
- 生存分析:该队列的中位随访时间为 83.5 个月,5 年总生存率(Overall Survival,OS)为 75%,5 年无复发生存率(Recurrence-Free Survival,RFS)为 69.6%。TNM 分期不同,OS 和 RFS 存在差异,虽无统计学意义,但随着肿瘤分期增加,生存率有下降趋势。
- 细胞遗传学和 BAP1 IHC 结果:14 例样本成功进行 SNP 阵列分析,共检测到 78 个染色体增益、48 个缺失和 2 个 CN-LOH。20%(4/20)的样本 BAP1 核染色缺失,且 BAP1 免疫反应性缺失与细胞遗传学分析中的单体或 CN-LOH 状态相符。根据 BAP1 状态分类,多数(11/14,79%)样本为低风险的 A/B 类肿瘤,少数(3/14,21%)为高风险的 C 类肿瘤。
- 与 TCGA-UM 队列的比较:与 TCGA-UM 队列相比,亚洲队列中 6 号染色体畸变最为常见,6q 缺失频率几乎是其两倍;9 号染色体改变频率更高,9q 增益与更长的无进展生存期(Progression-Free Survival,PFS)显著相关;1q 增益频率更高,且与更短的 PFS 显著相关;3 号染色体单体频率较低。在两个队列中,低 BAP1 表达均与较低的生存率显著相关。
在研究结论和讨论部分,研究人员指出,东南亚地区 UM 的分子分型应用不足,仅依靠 BAP1 IHC 检测进行预后评估存在局限性,需要扩展分子分型技术,如采用下一代测序或全基因组拷贝数分析等方法,以提高预后准确性。研究发现东南亚地区患者 3 号染色体单体发生率较低,这表明其在 UM 转移中的作用可能不如西方人群中那么重要,而其他因素或许更为关键。同时,8q 增益与较差预后的关联在亚洲队列中未得到证实,可能与亚洲人群中棕色虹膜和 Fitzpatrick 皮肤量表 III - V 级占主导有关。此外,研究还发现 1q 增益与较短 PFS 相关,且在亚洲队列中频率更高,这可能与疾病进展较晚有关,强调了早期检测和治疗的重要性。染色体 6p 缺失在转移患者中较为常见,虽样本量小无法得出确切结论,但提示其可能与转移风险相关。9q 增益在亚洲队列中与较长 PFS 显著相关,可能是一种潜在的保护性生物标志物,但还需进一步研究。研究中观察到的双峰年龄分布,可能反映了亚洲人群在 UM 发病方面的独特性,但仍需更大样本量的研究来证实。肿瘤大小和组织学方面,东南亚地区患者肿瘤多为晚期,延迟诊断问题较为突出,需要提高公众意识和优化早期检测策略。总之,该研究揭示了东南亚地区 UM 患者独特的遗传景观,为后续研究和临床实践提供了重要的参考依据,有助于推动针对该疾病的个性化治疗和更精准的预后评估。