大西洋和短吻鲟物种特异性引物开发:精准鉴别,守护濒危鱼类
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时间:2025年04月17日
来源:Conservation Genetics Resources 0.9
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为解决大西洋鲟(Acipenser oxyrinchus oxyrinchus)和短吻鲟(Acipenser brevirostrum)易误鉴及部分生命阶段难以准确识别的问题,研究人员开展利用细胞色素 b 序列开发分子引物的研究。结果显示引物能鉴别两种鲟鱼,此研究助力《美国濒危物种法》管理工作。
大西洋鲟(Acipenser oxyrinchus oxyrinchus)和短吻鲟(Acipenser brevirostrum)广泛分布于北美洲大西洋沿岸,它们会利用河流、河口和沿海栖息地。为了依据《美国濒危物种法》进行有效管理,了解这些鱼类的出现时间和地点至关重要。然而,这两种鱼类有时会被误认,而且像卵等某些生命阶段也难以准确鉴别。在这项研究中,研究人员利用细胞色素 b(cytochrome b)序列开发了分子引物,以此来确认短吻鲟和大西洋鲟样本的身份。研究人员使用这两个物种的参考 DNA 样本对这些引物进行了测试。结果表明,这些引物能够准确识别并区分大西洋鲟和短吻鲟。大西洋鲟引物的准确率为 95.34%,而短吻鲟引物的准确率为 90.7%。尽管存在一些个体未被准确识别(假阴性),但并未出现假阳性的情况。该研究并非旨在开发环境 DNA(eDNA)标记,而是为了创建物种特异性、未标记且成本效益高的引物,这些引物可以通过常规的聚合酶链式反应(PCR)进行扩增。扩增产物可以在 2% 的琼脂糖凝胶中通过电泳观察。整个过程成本相对较低,且所使用的都是大多数保护遗传学实验室常见的基础仪器。
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