
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
生物分子凝聚体对大颗粒物的可控正交分配机制研究
《Nature Communications》:
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月15日 来源:Nature Communications
编辑推荐:
编辑推荐:本研究通过构建表面功能化的聚合物纳米颗粒,结合实验、模拟和理论分析,揭示了生物分子凝聚体(condensates)对大颗粒物的分配规律:当颗粒-凝聚体相互作用足够强时,任意尺寸颗粒均可可控分配;不同表面化学性质的颗粒能正交靶向不混溶的凝聚体,为理解细胞区室化调控和药物靶向递送提供了新见解。
美国罗格斯大学Fleurie M. Kelley团队在《Nature Communications》发表的研究,通过巧妙设计表面功能化的聚苯乙烯(PS)纳米颗粒,结合分子动力学模拟和理论分析,系统探索了颗粒尺寸与表面化学性质对分配行为的影响。研究人员选用三种典型凝聚体模型系统:富含甘氨酸-精氨酸的LAF-1 RGG结构域、SARS-CoV-2核衣壳(N)蛋白和人工设计的阳离子多肽(GRGNSPYS)25,构建了从生物素化到寡核苷酸修饰的纳米颗粒工具箱。
关键技术包括:1)构建不同尺寸(100nm-1μm)和表面化学(PS、PS-PEG、PS-PEG-生物素/寡核苷酸)的荧光纳米颗粒;2)共聚焦显微成像定量分配系数;3)粗粒化分子动力学(MD)模拟Lennard-Jones粒子系统的相分离行为;4)理论模型推导分配能量方程。
研究首先通过葡聚糖(dextran)验证了经典尺寸排阻效应:70kDa葡聚糖的分配系数比10kDa低5倍。但核糖体和抗N蛋白IgG(150kDa)的异常分配暗示强相互作用可突破尺寸限制。分子模拟揭示关键规律:当颗粒-蛋白质相互作用能(ε12)与颗粒直径(σ2)满足ε12>0.382σ2时,任意大颗粒均可进入凝聚体。这完美解释了实验中1μm生物素化PS颗粒高效分配入SA-RGG凝聚体的现象,而PEG化颗粒因屏蔽相互作用被排斥。
表面化学工程展现出惊人特异性:在SA-RGG与N蛋白形成的非混溶体系中,生物素化颗粒选择性进入SA-RGG相(>99%),而polyA20修饰颗粒精准靶向N蛋白相(>97%)。这种"正交分配"效应通过调节寡核苷酸长度和密度实现精准调控——polyA40比polyA5分配效率提升50%,与理论预测的表面相互作用累积效应一致。
研究还发现环境因素可动态调控分配:盐浓度升高会驱逐静电依赖的PS-PEG-polyA颗粒;游离polyA20可竞争性置换已分配的颗粒,但生物素-链霉亲和素复合物因超强亲和力(Kd~10-15 M)形成动力学陷阱。这种可逆调控为理解细胞内凝聚体的动态组成提供了新视角。
该研究颠覆了"生物分子凝聚体存在绝对尺寸门槛"的传统认知,建立了基于相互作用强度的普适分配理论。在生物学层面,为核糖体在核仁中的矢量流动、HIV-1衣壳穿越NPC等现象提供了机制解释;在医学应用上,提出了靶向神经退行性疾病相关凝聚体(如含tau蛋白的凝聚体)的药物递送新策略。通过理性设计颗粒表面化学,未来或可实现抗癌药物对肿瘤特异性凝聚体的精准打击,为"凝聚体医学"开辟新途径。
生物通微信公众号
知名企业招聘