生物分子凝聚体对大颗粒物的可控正交分配机制研究

《Nature Communications》:

【字体: 时间:2025年04月15日 来源:Nature Communications

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  编辑推荐:本研究通过构建表面功能化的聚合物纳米颗粒,结合实验、模拟和理论分析,揭示了生物分子凝聚体(condensates)对大颗粒物的分配规律:当颗粒-凝聚体相互作用足够强时,任意尺寸颗粒均可可控分配;不同表面化学性质的颗粒能正交靶向不混溶的凝聚体,为理解细胞区室化调控和药物靶向递送提供了新见解。

  在细胞这个精密的微观世界里,生物分子凝聚体(biomolecular condensates)如同没有膜结构的"魔法泡泡",通过液-液相分离(LLPS)形成独特的化学微环境。这些动态的细胞器在基因调控、应激反应等关键生命过程中扮演着重要角色,但其组成调控机制尤其是对大尺寸客体的分配原则始终迷雾重重。传统观点认为,像核糖体(约21nm)或病毒衣壳(上百纳米)这样的"大块头"会被凝聚体拒之门外,然而HIV-1衣壳穿越核孔复合体(NPC)等特殊现象又暗示着例外可能。这种认知矛盾不仅阻碍了对细胞区室化的理解,更限制了靶向凝聚体的药物设计。

美国罗格斯大学Fleurie M. Kelley团队在《Nature Communications》发表的研究,通过巧妙设计表面功能化的聚苯乙烯(PS)纳米颗粒,结合分子动力学模拟和理论分析,系统探索了颗粒尺寸与表面化学性质对分配行为的影响。研究人员选用三种典型凝聚体模型系统:富含甘氨酸-精氨酸的LAF-1 RGG结构域、SARS-CoV-2核衣壳(N)蛋白和人工设计的阳离子多肽(GRGNSPYS)25,构建了从生物素化到寡核苷酸修饰的纳米颗粒工具箱。

关键技术包括:1)构建不同尺寸(100nm-1μm)和表面化学(PS、PS-PEG、PS-PEG-生物素/寡核苷酸)的荧光纳米颗粒;2)共聚焦显微成像定量分配系数;3)粗粒化分子动力学(MD)模拟Lennard-Jones粒子系统的相分离行为;4)理论模型推导分配能量方程。

研究首先通过葡聚糖(dextran)验证了经典尺寸排阻效应:70kDa葡聚糖的分配系数比10kDa低5倍。但核糖体和抗N蛋白IgG(150kDa)的异常分配暗示强相互作用可突破尺寸限制。分子模拟揭示关键规律:当颗粒-蛋白质相互作用能(ε12)与颗粒直径(σ2)满足ε12>0.382σ2时,任意大颗粒均可进入凝聚体。这完美解释了实验中1μm生物素化PS颗粒高效分配入SA-RGG凝聚体的现象,而PEG化颗粒因屏蔽相互作用被排斥。

表面化学工程展现出惊人特异性:在SA-RGG与N蛋白形成的非混溶体系中,生物素化颗粒选择性进入SA-RGG相(>99%),而polyA20修饰颗粒精准靶向N蛋白相(>97%)。这种"正交分配"效应通过调节寡核苷酸长度和密度实现精准调控——polyA40比polyA5分配效率提升50%,与理论预测的表面相互作用累积效应一致。

研究还发现环境因素可动态调控分配:盐浓度升高会驱逐静电依赖的PS-PEG-polyA颗粒;游离polyA20可竞争性置换已分配的颗粒,但生物素-链霉亲和素复合物因超强亲和力(Kd~10-15 M)形成动力学陷阱。这种可逆调控为理解细胞内凝聚体的动态组成提供了新视角。

该研究颠覆了"生物分子凝聚体存在绝对尺寸门槛"的传统认知,建立了基于相互作用强度的普适分配理论。在生物学层面,为核糖体在核仁中的矢量流动、HIV-1衣壳穿越NPC等现象提供了机制解释;在医学应用上,提出了靶向神经退行性疾病相关凝聚体(如含tau蛋白的凝聚体)的药物递送新策略。通过理性设计颗粒表面化学,未来或可实现抗癌药物对肿瘤特异性凝聚体的精准打击,为"凝聚体医学"开辟新途径。

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