探秘济宁呼吸道腺病毒：流行特征与基因奥秘揭示防控新方向

《BMC Genomics》：Epidemiological characteristics and genomic analysis of respiratory adenovirus in Jining City from February 2023 to July 2024

为了解人类腺病毒（HAdV）感染的防控难题，来自济宁等地的研究人员开展了对 2023 年 2 月至 2024 年 7 月济宁呼吸道腺病毒的流行病学特征和基因分析研究。结果发现 HAdV 在年轻群体中感染率高，且多种亚型共流行。该研究为 HAdV 防控提供了重要依据123。

　　腺病毒，这个看不见的 “小恶魔”，在我们生活中掀起不小的波澜。它能引发多种疾病，像发热、咳嗽，严重时甚至会导致肺炎，对人类健康构成严重威胁。尤其是在儿童群体中，它引发的呼吸道感染比例不容小觑，可达到 5% - 10%，而在成人中也有 1% - 7%。目前，针对呼吸道腺病毒，还没有广泛应用的疫苗，治疗手段也主要是对症处理，缺乏特效药物。为了更好地了解这个 “小恶魔”，来自齐鲁工业大学（山东省科学院）、济宁市疾病预防控制中心等机构的研究人员，开展了一项针对 2023 年 2 月至 2024 年 7 月济宁市呼吸道腺病毒的研究。该研究成果发表在《BMC Genomics》上，为我们防控腺病毒感染带来了新的曙光。
研究人员主要采用了核酸检测、全基因组测序、序列分析和系统发育分析等关键技术。从济宁市第一人民医院和任城区妇幼保健院收集了 3947 例流感样疾病患者的咽拭子样本，通过核酸检测确定 HAdV 的阳性率；对部分阳性样本进行全基因组测序，获取病毒的基因信息；运用多种软件对测序数据进行分析，构建系统发育树，探究病毒的进化关系和基因变异情况。
研究结果主要涵盖以下几个方面：

• 流行病学特征：研究发现，在 3947 例样本中，HAdV 阳性率为 3.42%。不同年龄组的感染率差异显著，5 - 15 岁组感染率最高，达到 7.63%，而 60 岁以上组感染率为 0%。性别和门诊 / 住院分组之间，HAdV 阳性率并无显著差异。从时间分布来看，2023 年 12 月至 2024 年 7 月阳性率较高，为 6.54% ，2023 年 1 月至 11 月则较低，仅 1.38%。此外，研究还检测到部分样本存在与其他病毒的共感染情况。
• 全基因组序列分析和亚属分析：对 48 个样本进行全基因组测序，成功获得 47 个样本的完整基因组序列。其中，38 例为 HAdV - B，9 例为 HAdV - C，未检测到 HAdV - E。所有 HAdV - B 序列均为 HAdV - 3 基因型，9 例 HAdV - C 中，4 例为 HAdV - 104，5 例为 HAdV - 108。
• 相似性分析：济宁市 47 个 HAdV 全基因组序列相似性在 66.87% - 99.99% 之间。38 个 HAdV - B 序列与中国 HAdV - B 候选疫苗株广州 01 的全基因组序列相似性为 99.08% - 99.45% ，与美国 HAdV - B 疫苗株 Gomen 的相似性为 97.05% - 97.37%。9 个 HAdV - C 序列相似性在 97.56% - 99.94% 之间。
• 系统发育分析：构建 HAdV - B 的全基因组、Penton base 基因、Hexon 基因和 Fiber 基因的系统发育树发现，38 个 HAdV - B 基因序列与中国 HAdV - 3 候选疫苗株广州 01 处于同一进化分支。对于 HAdV - C，5 个 HAdV - 108 序列和 4 个 HAdV - 104 序列分别位于不同进化分支。
• 氨基酸变异分析：与广州 01 相比，38 个 HAdV - B 菌株的 Penton base 蛋白有 4 个氨基酸突变和 1 个插入突变，Hexon 蛋白有 3 个氨基酸突变，Fiber 蛋白有 2 个氨基酸突变。9 个 HAdV - C 序列中，Penton base、Hexon 和 Fiber 蛋白分别有 9、26 和 11 个氨基酸差异，但 RGD 基序在所有 HAdV - C 序列中均未改变。
  研究结论和讨论部分指出，中国不同地区 HAdV 流行趋势差异较大，济宁儿童是 HAdV 感染的高危人群。此次研究还发现 HAdV - 3、HAdV - 104 和 HAdV - 108 是济宁的主要流行类型，丰富了全球 HAdV - 104 和 HAdV - 108 的基因组序列特征。此外，研究表明广州 01 候选疫苗株可能对济宁 HAdV - B 提供良好免疫保护，而美国 Gomen 株则效果不佳。该研究强调了对 HAdV 进行长期监测和开发多类型疫苗的必要性，为防控 HAdV 感染提供了重要的理论依据和实践指导，有助于公共卫生部门制定更有效的防控策略，保障人们的健康。