自然变异与基因编辑的界限：商业大豆根瘤菌E109的基因组可塑性支持碱基编辑菌剂的非转基因地位

为解决基因编辑微生物的监管分类争议，研究人员对商用大豆接种剂Bradyrhizobium japonicum E109的变异体开展基因组与生理学分析。通过全基因组测序和表型评估，发现商业菌株平均携带9.7个自然突变，其中91%位于编码区且82%为非同义突变，其效应与靶向6个位点的CRISPR碱基编辑相当。实验证实这些突变影响氧化应激抗性、根系附着及固氮效率，为碱基编辑菌剂归类为非转基因（non-GMO）提供了科学依据。

　　微生物监管领域正为基因编辑（genome editing）农用菌剂的分类争论不休。这项研究瞄准商用大豆根瘤菌（Bradyrhizobium japonicum）E109的天然变异体，通过全基因组测序（whole-genome sequencing）和表型分析，揭示商业菌株竟自带"编辑特效"——平均每个变异体携带9.7个单核苷酸突变，堪比靶向6个位点的CRISPR碱基编辑（base-editing）操作。更有趣的是，这些自然突变91%落在编码区，其中82%会引发氨基酸改变（非同义突变），可能重塑蛋白质功能。实验室里，这些"野生编辑"展现出氧化应激抗性、根系附着能力和固氮效率的波动，活像经历了一场自然界的CRISPR实验。该发现为监管机构送来"标尺"：既然商业菌剂本身就会积累类似基因编辑的变异，那么经过精准碱基编辑的菌株，或许该和传统非转基因（non-GMO）微生物享受同等待遇。