热激转录因子介导海洋硅藻耐热性与细胞大小可塑性的研究:解析关键分子机制及其生态意义

《Nature Communications》:

【字体: 时间:2025年04月11日 来源:Nature Communications

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  为探究硅藻适应不同温度的分子机制,研究人员开展了关于热激转录因子(HSFs)在硅藻耐热性中作用的研究。结果发现 PtHSF2 可增强硅藻耐热性、调节细胞大小,还明确了其调控机制及靶基因 PtCdc45-like 的功能,为理解硅藻温度适应提供了新视角。

  在全球变暖的大背景下,海洋温度不断攀升,这对海洋生态系统产生了深远影响。海洋硅藻作为海洋生态系统的重要组成部分,对维持生态平衡和全球气候稳定起着关键作用。它们不仅能进行大量的光合作用,固定约五分之一的全球二氧化碳,还广泛分布于各种海洋环境中,展现出宽泛的温度耐受性。然而,长期以来,科学家们对硅藻适应不同温度的分子机制却知之甚少。这一知识空白就像一层迷雾,阻碍着我们深入理解海洋生态系统在气候变化下的响应机制,也限制了我们预测未来海洋生态变化的能力。因此,探索硅藻耐热的分子机制迫在眉睫,它不仅有助于揭示海洋生态系统的奥秘,还能为应对气候变化提供科学依据。
为此,暨南大学的研究人员勇敢地踏上了探索之旅,开展了一项极具意义的研究。他们聚焦于热激转录因子(HSFs)在硅藻耐热性中的作用,经过不懈努力,取得了一系列重要成果。这些成果发表在《Nature Communications》上,为该领域的研究开辟了新的道路。
在研究过程中,研究人员运用了多种先进的技术方法。首先,他们利用 RNA 测序(RNA-seq)技术,全面分析了基因的表达变化,如同绘制了一幅基因表达的动态地图,让研究人员能够直观地看到哪些基因在不同条件下被激活或抑制。其次,切割标签法(CUT&Tag)发挥了关键作用,它帮助研究人员精准地识别出转录因子与 DNA 的相互作用位点,就像给研究人员提供了一把精确的 “分子剪刀”,能够准确地找到关键的调控区域。此外,研究人员还构建了转基因菌株,通过对这些菌株的生理特性进行分析,进一步验证了相关基因的功能,为研究结论提供了坚实的实验依据。
研究结果如下:
  1. PtHSF2 增强三角褐指藻对 30°C 的耐受性:研究人员对 15 种硅藻进行分析,发现 HSFs 是硅藻中最为丰富的转录因子家族。在三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)中,PtHSF2 在高温下显著上调,且其同源基因广泛存在于硅藻中。通过构建过表达和 RNA 干扰质粒,研究人员发现过表达 PtHSF2 的细胞在 30°C 下细胞密度更高、细胞更大、中性脂质含量增加,同时 ROS 和 MDA 水平降低,抗氧化酶活性增强,表明 PtHSF2 可介导细胞的热响应。
  2. 通过整合 RNA-seq 和 CUT&Tag 分析解读 PtHSF2 的调控机制:RNA-seq 分析显示,PtHSF2 过表达导致 1912 个基因显著差异表达,这些基因参与细胞周期调控、抗氧化防御等过程。CUT&Tag 分析确定了 295 个潜在的 PtHSF2 靶基因,其中 35 个与差异表达基因重叠。进一步研究发现,PtHSF2 直接靶向并上调 PtCdc45-like 和 Lhcx2,同时下调 ABC 转运蛋白,且其调控机制在 20°C 和 30°C 下保持稳定。
  3. PtCdc45-like 的功能鉴定:PtCdc45-like 在高温响应中起关键作用,过表达 PtCdc45-like 的细胞在 30°C 下细胞密度更高、体积更大,脂质饱和度指数降低,表明其与细胞大小和不饱和脂肪酸比例相关。此外,过表达 PtCdc45-like 还导致细胞周期相关基因表达改变,细胞在 S 和 G2期积累或停滞。
  4. PtHSF2 和 PtCdc45-like 的相互调控:研究发现 PtHSF2 和 PtCdc45-like 之间存在正反馈调节。敲低 PtCdc45-like 可缓解 PtHSF2 过表达引起的生长迟缓,但在热应激下会降低细胞密度。这表明 PtCdc45-like 是 PtHSF2 调节细胞大小和热响应的关键介质。
  5. PtCdc45-like 过表达提高耐热性:过表达 PtCdc45-like 的细胞在 30°C 下存活率显著提高,ROS 和 MDA 水平降低,CAT 活性升高,表明其增强了细胞的抗氧化防御能力,从而提高了对高温的耐受性。在其他硅藻物种中,PtHSF2 和 PtCdc45-like 的同源基因也在高温下上调,暗示这一调控机制在硅藻中可能具有保守性。
    研究结论和讨论部分指出,该研究揭示了 PtHSF2 在调节硅藻耐热性和细胞大小可塑性方面的重要作用,拓展了 HSFs 的功能认知。虽然细胞体积增大与耐热性之间的直接因果关系尚未明确,但研究表明 PtHSF2 和 PtCdc45-like 的表达变化与热应激响应密切相关。此外,研究还发现不同物种中 HSF2 和 Cdc45-like 的同源基因差异可能解释其热耐受性的差异。这些发现为深入理解硅藻的温度适应机制提供了重要线索,有助于我们更好地预测海洋生态系统在气候变化下的变化趋势,为保护海洋生态环境提供理论支持。
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