巴西 55 年（1967 - 2022 年）猪圆环病毒 2 型（PCV2）的进化探秘：速率、模式与意义

《Archives of Virology》：Porcine circovirus type 2 (PCV2) in Brazil in the past 55 years (1967-2022): evolutionary rates and patterns

为探究猪圆环病毒 2 型（PCV2）的遗传变异情况，研究人员对 1967 - 2018 年巴西猪群组织样本进行回顾性分析。研究发现 PCV2 有高多样性和进化速率，多数巴西分离株与 PCV2d 相似，该结果有助于了解 PCV2 在巴西的遗传多样性、进化和传播模式。

　　猪圆环病毒 2 型（Porcine circovirus type 2，PCV2）是一种常见的猪感染病毒，其遗传变异性显著，受疫苗接种和商业贸易等因素影响。在这项研究中，研究人员基于分子特征、贝叶斯推断和单倍型网络，对 1967 年至 2018 年巴西猪群组织样本中的 PCV2 进行回顾性分析。研究人员针对 PCV2 衣壳基因的 225 个核苷酸片段进行巢式 PCR（Nested PCR），随后进行双向测序。在检测的 178 个样本中，39 个（21.9%）PCV2 呈阳性。系统发育分析显示，在 PCV2 疫苗引入前收集的菌株与基因型 2d 参考菌株聚类。PCV2 的平均替换率为每年每位点 1.54×10^-3次替换（s/s/y），单倍型多样性为 0.98，这表明 PCV2 具有高突变率，与单倍型网络中的拓扑结构相符。研究表明，包括疫苗引入前的大多数巴西分离株都与 PCV2d 参考菌株相似，这意味着该基因型在巴西疫苗引入前就已传播。其中一个 PCV2 序列来自 1967 年的分离株，这是美洲测序的最古老分离株，也是全球第二古老的。系统发育分析和单倍型网络分析表明 PCV2 具有高度多样性和高进化速率。这些结果增进了我们对 PCV2 在巴西的遗传多样性、进化和传播模式的了解。