《Human Genetics》:The molecular landscape of hereditary ataxia: a single-center study
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遗传性共济失调(HA)因表型和遗传病因多样,诊断面临挑战。研究人员开展了对 70 例基因未明确的 HA 患者的分子特征研究,采用重复扩增分析和全外显子测序(WES)。结果发现 40% 患者有致病 / 可能致病变异,该研究为 HA 诊断提供了重要依据。
遗传性共济失调(Hereditary Ataxia,HA)是一类复杂且神秘的神经系统疾病,如同隐藏在人体神经通路中的 “暗礁”,常常让患者的生活陷入困境。它有着多种多样的临床表现,比如走路不稳、说话含糊不清、肢体协调性变差等,这些症状就像一张张难以捉摸的 “面具”,让诊断变得异常困难。而且,其遗传病因也极为复杂,各种遗传模式都有涉及,这就像一团乱麻,让医生和研究人员难以理清头绪。
目前,虽然医学技术不断进步,但仍有大约 50% 的 HA 患者无法得到明确的基因诊断。这就好比在黑暗中摸索,患者不知道自己疾病的根源,无法获得精准的治疗方案,也难以对疾病的发展进行预测,甚至会影响到家庭的生育计划。因此,找到一种更有效的诊断方法迫在眉睫。
在这样的背景下,意大利乌迪内大学附属医院(Azienda Sanitaria Universitaria Friuli Centrale)的研究人员挺身而出,开启了一项极具意义的研究。他们希望通过深入探索 HA 的分子机制,找到提高诊断率的方法,为患者带来希望的曙光。
研究人员对 70 例基因未明确的 HA 患者进行了研究,采用了两步法的研究策略。首先,对患者样本进行已知 HA 相关重复扩增的分析,若结果为阴性,则进一步进行全外显子测序(Whole Exome Sequencing,WES)。
研究人员用到的主要关键技术方法如下:从 70 例患者外周血样本中提取基因组 DNA;运用重复引物 PCR(Repeat-primed PCR,RP-PCR)检测特定基因的重复序列;通过 WES 分析基因变异,并使用 Varsome Clinical 平台进行变异检测和注释;采用 Sanger 测序验证部分变异;利用定量 PCR(Quantitative PCR,qPCR)等技术辅助研究;运用牛津纳米孔技术(Oxford nanopore technologies,ONT)对特定基因重复长度进行精准测定。
下面来看具体的研究结果:
患者队列特征 :70 例患者中,男性 45 例(64.3%),女性 25 例(35.7%),中位年龄 65.5 岁。家族史阳性的患者占 28.57%,62.86% 为散发性病例,8.57% 家族史未知。患者的临床表现高度异质,涵盖了多种类型的共济失调症状。通过对患者样本的分析,研究人员详细了解了该队列的基本情况,为后续研究奠定了基础。
重复扩增分析结果 :RP-PCR 检测发现,14.3%(10/70)的样本存在致病性重复扩增,涉及 ATXN1、ATXN2、TBP、FXN 等基因。例如,在部分患者中检测到 ATXN1 基因的 CAG 重复数异常,这一结果与常见的遗传性共济失调疾病相关,表明重复扩增在 HA 发病机制中起着重要作用。
WES 分析结果 :对 60 例 RP-PCR 检测阴性的样本进行 WES 分析,30%(18/60)的患者检测结果为阳性,发现了多种致病或可能致病的变异,涉及 20 个不同的基因,如 SQSTM1、RORA、CYP27A1 等。这些基因变异与多种神经系统疾病相关,进一步揭示了 HA 遗传异质性的特点。同时,23.3%(14/60)的患者检测结果为不确定,存在意义未明的变异(Variants of Unknown Significance,VUS),这也为后续研究提出了挑战。
综合检测结果 :综合重复扩增和 WES 数据,40%(28/70)的患者检测结果为阳性,20%(14/70)为不确定,5.7%(4/70)仅检测到偶然发现的变异,34.3%(24/70)检测结果为阴性。此外,对 26 例患者亲属的分离分析发现,46.2%(12/26)的个体遗传了有害变异,其中 7 例有症状,这为遗传咨询提供了重要依据。
研究结论和讨论部分指出,本研究通过对 70 例患者的分析,发现联合使用重复扩增分析和 WES,结合详细的临床表型分析,能够在近 50% 的病例中检测到导致共济失调的分子改变,且不受遗传模式的影响。这一成果为 HA 的诊断提供了重要的参考,有助于提高诊断的准确性。然而,研究也存在一定的局限性,如样本量相对较小,重复扩增分析未涵盖部分常见疾病相关的重复序列,WES 技术本身也存在一定的局限性,无法很好地检测长程结构变异。尽管如此,该研究仍然具有重要意义,它进一步证实了 HA 的广泛遗传异质性,强调了 NGS(Next-Generation Sequencing,下一代测序)技术在神经遗传学疾病诊断中的重要性,为未来的研究指明了方向。未来的研究可以进一步扩大样本量,优化检测技术,以提高 HA 的诊断率,为患者提供更精准的诊断和治疗方案,让患者能够更好地应对这一疾病带来的挑战。
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