鸡多组织基因表达的遗传调控：绘制调控变异图谱及跨物种复杂性状基因定位的关键

为解决鸡基因组功能变异缺乏系统表征的问题，研究人员整合 7015 个样本的批量 RNA 测序（RNA-seq）数据、127598 个细胞的单细胞 RNA-seq 数据和 2869 个全基因组序列，开展鸡 28 种组织调控变异研究。绘制调控变异图谱，揭示分子机制，助力跨物种基因定位，意义重大。

　　鸡是理解基础生物学和脊椎动物进化的重要模型，也是全球主要的营养丰富的瘦肉蛋白来源。尽管鸡是首个完成基因组测序的非哺乳动物羊膜动物，但对其基因组功能变异的系统表征仍有欠缺。在此，研究整合了 7015 个样本的批量 RNA 测序（RNA-seq）数据、127598 个细胞的单细胞 RNA-seq 数据以及 2869 个全基因组序列，绘制出 28 种鸡组织调控变异的初步图谱。该图谱揭示了数百万种对初级表达（蛋白质编码基因、长链非编码 RNA 和外显子）和转录后修饰（可变剪接和 3′非翻译区可变多聚腺苷酸化）的调控作用。研究突出了这些调控变异背后独特的分子机制、它们的环境依赖行为，以及在解释 39 种鸡复杂性状全基因组关联方面的实用性。最后，对鸡和哺乳动物基因调控的比较分析表明，这一资源可如何促进复杂性状的跨物种基因定位。