从患病澳洲鱼类中分离出柱状病致病菌 —— 科瓦黄杆菌（Flavobacterium covae）：填补研究空白，助力水产健康管理

《Microbiology Resource Announcements 0.7》：Columnaris-causing bacteria Flavobacterium covae isolated from diseased fish in Australia

为明确澳大利亚鱼类柱状病的致病原，来自悉尼大学的研究人员对患病尖吻鲈（Lates calcarifer）开展研究。他们分离出一株新菌株 FC5 - 24/06，经鉴定为科瓦黄杆菌（F. covae），这是澳大利亚首次报道该菌，有助于水产养殖疾病防控。

　　柱状病是一种在全球范围内普遍存在的淡水鱼类疾病。过去，柱状黄杆菌（Flavobacterium columnare）被认为是唯一的致病原因，但近期研究将其重新分类为四种导致柱状病的细菌（CCB），包括柱状黄杆菌（F. columnare）、科瓦黄杆菌（F. covae）、戴维斯黄杆菌（F. davisii）和奥尼罗非鱼黄杆菌（F. oreochromis）。2024 年，澳大利亚新南威尔士州卡姆登的一个尖吻鲈（Lates calcarifer）养殖场报告了一起疾病爆发事件，患病鱼苗出现 “鞍背” 损伤、鳞片脱落、鳍腐病和死亡率上升等症状。研究人员从濒死鱼苗的头部到肾脏采集诊断样本，在选择性改良的谢伊琼脂上培养，经多次传代后提取 DNA。对一株名为 FC5 - 24/06 的单菌落进行基因组测序，使用牛津纳米孔技术（ONT），经质量筛选和从头组装后得到其草图基因组。通过平均核苷酸同一性（ANI）比较基因组学，确定 FC5 - 24/06 为科瓦黄杆菌（F. covae），这是澳大利亚首次报道该菌。此外，研究人员还进行了基因组注释和多位点序列分析（MLSA），系统发育分析显示 FC5 - 24/06 与泰国的两株科瓦黄杆菌（F. covae）菌株聚类。该研究为澳大利亚水产养殖中柱状病的防控提供了重要依据，扩大对 CCB 的基因组监测对疾病管理和减少抗菌素耐药性至关重要。