《Scientific Reports》:Time-warping analysis for biological signals: methodology and application
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在生物信号分析中,传统数据处理方法易丢失关键信息。研究人员开展弹性功能数据分析(EFDA)在生物信号时间扭曲分析的研究。结果显示,EFDA 能精准对齐信号、分离时空变异性,揭示传统方法隐藏的特征,对理解生物信号意义重大。
在生命科学研究的舞台上,生物信号就像一部部神秘的 “时间剧集”,记录着生命活动的点滴。这些信号在时间和空间维度上充满了变化,就像不同演员对同一剧本有着独特演绎。以往,科学家们在分析这些信号时,常采用均值和方差来总结其特征。这就好比把所有 “剧集” 剪辑成一样的时长,再求个平均,却发现很多精彩情节被剪掉了。传统方法中,数据填充或重采样虽能让信号长度一致,却可能掩盖信号的关键信息,导致重要特征被忽略,就像戴着模糊的眼镜看世界,难以看清生物信号背后的真实 “剧情”。为了打破这一困境,来自美国东北大学(Northeastern University)等机构的研究人员踏上了探索之旅,开展了关于时间扭曲分析在生物信号中的研究,相关成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员主要运用了弹性功能数据分析(EFDA)这一关键技术。他们通过合成具有已知特征的信号以及采集人类复杂操作任务中的真实数据,对 EFDA 与传统的数据处理方法进行对比。在合成数据实验中,他们利用特定的高斯函数生成带有噪声的信号,并设置了不同的参数来模拟真实信号的变异性;在真实数据实验中,收集了新手和专业人员使用鞭子击打目标的动作数据,这些数据来自于经机构审查委员会批准的实验,参与者均签署了知情同意书 。
下面来看看具体的研究结果:
- 时间扭曲分析方法概述:研究表明,传统的时间序列平均方法,如零填充和时间归一化,存在诸多缺陷。以合成的双峰信号为例,零填充会使信号后期样本数减少,影响均值计算,还可能产生虚假特征;时间归一化虽能使信号长度一致,但会导致峰值变形,无法准确反映信号的真实特征。而时间扭曲分析,尤其是 EFDA,通过对信号时间尺度的调整,能更好地对齐信号,提取其显著特征。这就像给 “时间剧集” 重新剪辑,让每个情节都能在合适的时间展现,更准确地反映出信号的真实面貌。
- 通过时间扭曲对齐和估计时空变异性:EFDA 在对齐信号时,使用 Fisher - Rao 距离来量化信号间的差异。通过将信号转换为平方根速率函数(SRRF),再计算 L2范数得到 Fisher - Rao 距离,这种方法能有效避免信号的过度拉伸和压缩(“捏合” 现象)。在对齐多组时间序列后,EFDA 还能分别量化空间变异性(VarSpat)、时间变异性(VarTemp)以及时间变异性对空间的贡献(VarTemp2Spat) ,实现对信号时空变异性的全面解析。
- 时间扭曲在合成数据集上的优势:在合成数据集实验中,研究人员生成了具有特定参数和噪声的信号,对比了时间填充、时间归一化和时间扭曲三种方法。结果发现,时间扭曲方法在提取信号特征方面表现出色,其估计的参数误差比传统方法小得多。例如,在估计峰值幅度和峰宽时,时间扭曲方法的准确性比传统方法高近 100 倍和 10 倍,能更准确地反映信号的真实特征,让 “模糊的信号图像” 变得清晰。
- 时间扭曲在复杂真实运动中的应用:将 EFDA 应用于人类使用鞭子的复杂运动数据中,研究人员发现,与传统方法相比,时间扭曲对齐能使信号均值更尖锐,变异性更低,还能揭示出传统方法无法显示的细微特征,如专家手部运动轨迹中的多个峰值,反映出其复杂的动作过程。同时,通过分析不同参与者手部速度的变异性,发现专家和新手在时间变异性上相似,但专家的时间变异性对空间的贡献更低,这表明专家虽手部运动执行速率有变化,但这些变化可能对任务完成更有利。
在研究结论和讨论部分,研究人员指出,传统的变异性估计方法往往只关注空间变异性,忽略了时间变异性的影响,导致信号特征被模糊。而 EFDA 通过分解观察到的变异性为时间和空间成分,为科学研究提供了新的视角。在合成数据和真实实验数据中,EFDA 都展现出了强大的优势,能够揭示传统方法无法发现的信号特征,为生物信号分析提供了更精确的工具。这一研究成果在运动神经科学等领域具有重要意义,有助于深入理解人类运动控制机制,为相关疾病的研究和治疗提供新的思路,也为未来生物信号分析技术的发展指明了方向,就像为生物信号研究点亮了一盏新的明灯,照亮了那些曾经隐藏在黑暗中的重要信息。
总之,这项研究通过 EFDA 技术为生物信号分析带来了新的突破,让我们能更深入地解读生物信号背后的奥秘,为生命科学研究注入了新的活力。
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