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为探究精子衍生的 H2AK119ub1对胚胎发育的贡献,研究人员以非洲爪蟾为模型开展相关研究。结果发现精子 H2AK119ub1可指导卵因子介导的父本染色质表观遗传重塑,对胚胎发育至关重要。该研究为理解代际间表观遗传信息传递提供了新视角。
在生命的奇妙旅程中,胚胎发育一直是科学家们探索的核心领域。众多研究表明,精子在胚胎发育中起着重要作用,其携带的表观遗传信息可能影响着胚胎的成长。然而,目前仍缺乏直接检测精子修饰组蛋白在胚胎发育中作用的实验方法,这成为了该领域研究的一大阻碍。为了填补这一空白,来自法国南特大学(Nantes Université)、日本东京药科大学(Tokyo University of Pharmacy and Life Science)、美国哈佛医学院(Harvard Medical School)等多个研究机构的研究人员展开了深入研究,相关成果发表在《Nature Communications》上。
研究人员采用了多种关键技术方法。在样本处理方面,收集非洲爪蟾的精子、卵子和胚胎等样本。运用染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)技术,分析精子基因组中 H2AK119ub1等组蛋白修饰的分布情况;通过 RNA 测序(RNA-seq)技术,探究胚胎基因表达的变化。此外,还利用体外编辑实验,用 H2AK119ub1去泛素化酶 USP21 处理精子,以研究其对胚胎发育的影响。
研究结果如下:
- H2AK119ub1在精子和早期胚胎中的存在:研究发现,在非洲爪蟾精子发生和早期胚胎发育过程中,H2AK119ub1均存在。精子发生时,尽管 H2A 部分丢失,但 H2AK119ub1仍维持一定水平;早期胚胎发育时,在合子基因组激活(ZGA)前后及原肠胚形成、神经胚形成阶段,H2AK119ub1也可被检测到,这表明其具备从精子向胚胎传递表观遗传信息的潜力。
- H2AK119ub1与精子基因调控区域的关联:通过 H2AK119ub1的染色质免疫沉淀实验(ChIP),研究人员发现 H2AK119ub1在部分精子基因的转录起始位点(TSS)附近积累,且与发育相关基因有关。同时,H2AK119ub1在精子基因组的远端区域也有积累,并且与精子基因调控元件(启动子和增强子)显著相关。此外,H2AK119ub1与 H3K4me3、H3K27me3等修饰存在一定关联,在部分基因组位点存在共富集现象。
- 精子 H2AK119ub1受卵因子重塑:利用间期卵提取物模拟受精后精子染色质的重塑过程,研究发现精子暴露于卵因子后,H2AK119ub1发生了显著的重新分布。大量基因组位置在精子染色质复制后获得 H2AK119ub1,且大部分复制诱导的 H2AK119ub1重新分布发生在基因间区域,而稳定的 H2AK119ub1峰大多位于启动子上。
- 精子 H2AK119ub1影响卵因子介导的染色质重塑:用 USP21 处理精子以去除 H2AK119ub1后发现,卵因子介导的 H2AK119ub1在父本染色质上的沉积减少,同时出现了新的 H2AK119ub1峰,且其积累位置从 CpG 岛转移到了重复元件。这表明母源因子介导的精子 H2AK119ub1重新分布受父本染色质中预先存在的 H2AK119ub1的指导。
- 精子 H2AK119ub1缺失改变胚胎基因表达:利用父源胚胎研究发现,用 USP21 处理精子会降低胚胎的发育潜力,导致胚胎基因表达失调,其中多数基因上调。转录组分析表明,这些受影响的基因与细胞周期过程相关,且多为母源 - 合子基因(MZ 基因)。
- 受调控异常的基因是精子中 H2AK119ub1/H3K4me3的靶点:研究发现,对精子 USP21 处理敏感的基因与 H2AK119ub1存在关联,尤其是双价 H2AK119ub1/H3K4me3染色质状态的基因。精子复制后,USP21 敏感基因的 H2AK119ub1和 H3K4me3信号在 TSS 附近高于整体基因,且精子 H2AK119ub1编辑会导致这些基因在复制后与 H2AK119ub1的结合减少。
研究结论表明,精子来源的 H2AK119ub1对胚胎发育至关重要,它指导着卵因子介导的父本染色质表观遗传重塑,影响胚胎基因表达和发育能力。该研究揭示了精子表观基因组在胚胎发育中的重要作用,为理解代际间表观遗传信息传递提供了关键线索,有助于进一步探究胚胎发育的分子机制,为相关疾病的研究和治疗提供新的思路。在讨论部分,研究人员指出,虽然发现了精子 H2AK119ub1的重要作用,但目前对于非洲爪蟾胚胎发育前期 H2AK119ub1的基因组分布情况仍知之甚少,未来还需更多研究来深入了解其在胚胎发育过程中的详细机制。