海洋嗜盐菌来源生物活性化合物:体外及计算机模拟对接研究 —— 探寻水产养殖细菌感染治疗新契机
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时间:2025年04月06日
来源:Marine Biotechnology 2.6
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为探究海洋嗜盐菌潜在应用价值,研究人员从海水和土壤沉积物样本中分离 12 株嗜盐菌。经研究发现,Vibrio alginolyticus(T7)和Aeromonas veronii(N5)的乙酸乙酯提取物(EAE)含多种化合物,且A. veronii的 EAE 对病原体更有效,这为水产养殖细菌感染治疗提供新思路。
海洋嗜盐菌因其具有拮抗活性、生物还原活性以及在临床和益生菌等方面的潜在应用价值,受到了广泛关注。研究人员从海水和土壤沉积物样本中总共分离出 12 株嗜盐菌菌株。对所有分离菌株的无细胞上清液进行初步抗菌筛选后,发现 T7 和 N5 菌株表现出显著的抗菌效果。经分离这两种菌株的基因组 DNA 并进行核苷酸测序,确认 T7 菌株为溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus),N5 菌株为维氏气单胞菌(Aeromonas veronii) 。研究人员用乙酸乙酯提取物(EAE)中的细菌次生代谢产物,对哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)、副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、弧菌属(Vibrio spp.)和气单胞菌(Aeromonas hydrophila)等病原体进行测试。傅里叶变换红外光谱(FT-IR)对 EAE 的表征显示,在每个分离菌株(T7 和 N5)中都存在 9 种主要为烷烃和酰胺的官能团。气相色谱 - 质谱联用仪(GC-MS)从溶藻弧菌(V. alginolyticus)(T7)中鉴定出 9 种化合物,从维氏气单胞菌(A. veronii)(N5)中鉴定出 4 种化合物。研究人员对 12 种化合物与病原体的蛋白质(DNA 促旋酶亚基 B 和拓扑异构酶 IV(Topo IV))进行了分子对接,揭示了配体与相应靶点结合位点的潜在结合模式。溶藻弧菌(V. alginolyticus)的邻苯二甲酸癸酯对病原体的促旋酶 B(gyrB)和拓扑异构酶 IV(Topo IV)蛋白的结合亲和力值为 -5.5 至 -6.6 千卡 / 摩尔,而维氏气单胞菌(A. veronii)的邻苯二甲酸、2 - 乙基己基十五烷基酯和邻苯二甲酸二(2 - 乙基己基)酯对鱼类病原体促旋酶 B(gyrB)蛋白和拓扑异构酶 IV(Topo IV)的结合亲和力值分别高达 -6.1 至 -7.2 千卡 / 摩尔和 -5.7 至 -6.8 千卡 / 摩尔。结果表明,与其他病原体相比,具有配体结合亲和力的蛋白质对哈维氏弧菌(V. harveyi)和气单胞菌(A. hydrophila)的抑制作用更强。总体而言,维氏气单胞菌(A. veronii)的 EAE 中的化合物对病原体的抑制效果,要比溶藻弧菌(V. alginolyticus)的 EAE 中的化合物更显著。因此,还需要进一步研究,以探索这些化合物在水产养殖环境中治疗细菌感染的潜在治疗应用。
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