柠檬香蜂草(Melissa officinalis)微小 RNA(miRNA):神经退行性疾病潜在的跨王国调控 “密码”
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时间:2025年04月06日
来源:Genome Instability & Disease
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为探究柠檬香蜂草(Melissa officinalis)植物 miRNA 在神经退行性疾病中的作用,研究人员开展相关研究。他们识别出 29 种新型保守 miRNA 及 99 个潜在人类基因靶点,发现部分关键基因参与多种神经退行性疾病通路,这有助于理解 miRNA 功能及调控机制。
微小 RNA(miRNA)是内源性分子,在植物和动物的众多生理过程中发挥重要调控作用。miRNA 的关键作用是通过与成熟转录本的 3′非翻译区(3′ UTR)结合来沉默基因,这使其有望成为多种疾病的生物标志物。柠檬香蜂草(Melissa officinalis)具有重要的民族药用价值。大量研究充分证明了植物来源的小非编码 miRNA 具有跨王国转录后调控潜力。在植物基因组学方法的支持下,首次对柠檬香蜂草进行了计算机模拟 miRNA 分析并取得重大进展。本研究旨在识别并揭示柠檬香蜂草植物 miRNA 在神经退行性疾病中的作用。当前研究分别利用序列相似性搜索和 mfold 网络服务器,在转录组范围内识别出 29 种新型保守 miRNA,共有 99 个潜在的人类基因靶点,通过 psRNATarget 和 Cytoscape 确定了前 10 个潜在的中心节点,即 ESR1、CASP8、SPTBN1、RPL27A、IRF8、PRKCB、QKI、IGF2BP1、TTLL12 和 NUP153,这些靶点受 miR4995、miR397b、miR397-5p、miR397b-5p、miR396g-3p、miR2914 和 miR397 等 miRNA 家族的靶向作用。此外,利用 Funrich 软件对靶向基因进行注释,并在 KEGG 通路数据库中进行疾病关联研究。研究发现,所识别的这类小 RNA 与神经退行性疾病及多种癌症相关。因此,确定的前 4 个中心基因 CASP8、SPTBN1、PRKCB 和 TTLL12 在阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、脊髓小脑性共济失调和轴突疾病等神经退行性疾病通路中起着关键作用。这些发现有助于进一步理解 miRNA 在人类中的功能及其调控机制,为其他研究目标的实施奠定基础。
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