基于血液转录组的人类衰老相关基因表达分析与年龄预测模型构建
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时间:2025年04月05日
来源:Biogerontology 4.4
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编辑推荐:针对血液转录组年龄预测模型匮乏的问题,研究人员利用10K Immunomes数据库中21-90岁健康人群数据,通过LASSO、EN、XGBoost和LightGBM算法构建模型,发现梯度提升决策树模型(XGBoost r=0.931/LightGBM r=0.645)显著优于线性回归,为生物衰老监测提供新工具。
科学家们深入探索了人类血液转录组中与衰老相关的基因表达变化,并建立了创新的年龄预测模型。研究团队从10K Immunomes数据库获取21-90岁健康志愿者的转录组数据,系统分析了差异表达基因,通过基因本体论(GO)、通路和疾病本体论分析揭示了这些基因的生物学功能特征。研究采用四种机器学习算法——最小绝对收缩选择算子(LASSO)、弹性网络(EN)、极限梯度提升(XGBoost)和轻量梯度提升机(LightGBM)构建预测模型。结果显示,基于决策树的XGBoost(142个基因)和LightGBM(149个基因)模型表现优异,训练集相关系数分别达到1.000和0.995,测试集为0.931和0.915,外部验证集为0.591和0.645,显著优于仅使用7-9个基因的线性回归模型。这些发现为开发简便的生物衰老监测工具提供了新思路,同时为理解基因表达与衰老表型之间的分子机制奠定了基础。未来研究需要在更广泛人群中验证这些模型,并深入探索相关基因在衰老过程中的作用机制。
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