《Molecular Horticulture》:Comprehensive characterization of volatile terpenoids and terpene synthases in Lanxangia tsaoko
编辑推荐:
为探究草果(Lanxangia tsaoko)挥发性代谢物的生物合成机制,研究人员开展了多组学及功能表征研究。结果表明萜类化合物在草果挥发性成分中占比最高,鉴定出 42 个萜烯合酶(TPS)编码基因,部分 LtTPSs 可催化生成单萜和倍半萜。该研究为理解草果挥发性萜类生物合成提供依据。
草果,这种在我们生活中并不陌生的植物,它既是烹饪中不可或缺的香料,为各种美食增添独特风味,又是传统中医里的一味良药,被用于治疗多种疾病。草果之所以有如此独特的功效,主要得益于其丰富的挥发性代谢物。然而,以往的研究大多只是简单地对草果中的成分进行分类和探究其药理活性,对于这些代谢物的生物合成机制,我们了解得还远远不够。就好比一座宝藏就在眼前,我们却只看到了表面的光芒,对于其内部的构造和秘密知之甚少。
为了深入挖掘草果挥发性代谢物的奥秘,中国中医科学院中药研究所等机构的研究人员开展了一项极具意义的研究。他们通过一系列严谨的实验和分析,取得了一系列重要成果,这些成果发表在《Molecular Horticulture》杂志上,为我们认识草果打开了新的大门。
在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先是代谢组学技术,通过对草果不同组织的挥发性化合物进行分析,来了解其挥发性成分的组成和分布。其次是转录组学技术,用于研究相关基因的表达情况,探索基因与挥发性化合物合成之间的关系。此外,还有基因克隆和功能鉴定技术,对筛选出的基因进行功能验证 ,确定它们在挥发性萜类化合物合成中的具体作用。
研究人员先对草果不同组织进行代谢组学分析。他们运用气相色谱 - 质谱联用(GC - MS)技术,对草果的根、茎、花、叶、果实和果柄 6 个组织中的挥发性化合物进行检测。主成分分析(PCA)显示检测结果可靠,不同组织间代谢差异明显。研究共检测到 1009 种挥发性化合物,萜类化合物占比最高(20.5%),且在果实和花中含量较高。KEGG 富集分析表明差异代谢物在单萜生物合成途径显著富集,说明萜类化合物是草果主要活性成分,且果实和花中萜类最为丰富。
接着,研究人员对萜类生物合成上游基因进行鉴定。通过分析 MEP 和 MVA 途径关键基因,发现多数基因有多个拷贝,全基因组复制(WGD)事件对这些上游基因的扩增贡献显著。转录组分析显示,多数上游基因在花和果实中高表达,与代谢组结果相符,表明这些基因可能参与单萜生物合成,促进萜类在花和果实中积累。
之后,研究人员对 LtTPSs 进行系统分析。在草果基因组中鉴定出 42 个 LtTPSs,根据理化性质和系统发育分析将其分为 6 个亚家族。基因复制事件分析表明,分散复制(DSD)和近端复制(PD)促使 TPS - a/b 亚家族基因扩增,可能增加挥发性萜类的多样性和丰富度。转录组分析显示,部分 LtTPSs 在花和果实中优势表达,可能对花和果实中挥发性萜类生物合成至关重要。
最后,研究人员对 LtTPSs 进行功能表征。成功克隆 18 个 LtTPSs,利用工程菌株验证其功能。结果显示,4 个 LtTPS 酶具有倍半萜合酶活性,8 个可将香叶基焦磷酸(GPP)转化为单萜,LtTPS23 和 LtTPS42 具有双功能活性。不同 LtTPSs 催化产物不同,即使序列相似的基因,催化活性也可能存在差异,反映了萜类生物合成途径的复杂性。
综合来看,该研究首次全面解析了草果挥发性萜类化合物及萜烯合酶,揭示了萜类化合物在草果中的重要地位和生物合成机制。研究发现草果挥发性化合物中萜类占主导,鉴定出多个参与萜类合成的基因,明确了基因复制对萜类多样性的影响。这不仅为深入了解草果的生物学特性提供了理论依据,也为后续利用基因工程技术提高草果中有益萜类化合物的产量,开发新型药物和香料奠定了坚实基础。同时,该研究为其他植物挥发性代谢物的研究提供了参考范例,有助于推动植物代谢工程领域的发展,进一步挖掘植物中潜在的生物活性成分,为人类健康和生活带来更多福祉。
婵炴垶鎸搁鍫澝归崶鈹惧亾閻熼偊妲圭€规挸瀛╃€靛ジ鏁傞悙顒佹瘎闁诲孩绋掗崝鎺楀礉閻旂厧违濠电姴娲犻崑鎾愁潩瀹曞洨鐣虹紓鍌欑濡粓宕曢鍛浄闁挎繂鐗撳Ο瀣煙濞茶骞橀柕鍥ㄥ哺瀵剟骞嶉鐣屾殸闂佽偐鐡旈崹铏櫠閸ф顥堥柛鎾茬娴狀垶鏌曢崱妤婂剱閻㈩垱澹嗗Σ鎰板閻欌偓濞层倕霉閿濆棙绀嬮柍褜鍓氭穱铏规崲閸愨晝顩烽柨婵嗙墦濡鏌涢幒鎴烆棡闁诲氦濮ょ粚閬嶅礃椤撶姷顔掗梺璇″枔閸斿骸鈻撻幋锔藉殥妞ゆ牗绮岄埛鏍煕濞嗘劕鐏╂鐐叉喘閹秹寮崒妤佹櫃
10x Genomics闂佸搫鍊瑰姗€骞栭—娓媠ium HD 閻庢鍠掗崑鎾绘煕濮樼厧鐏犵€规洜鍠撶槐鎺楀幢濮橆剙濮冮梺鍛婂笒濡粍銇旈幖浣瑰仢闁搞儮鏅滈悾閬嶆煕韫囧濮€婵炴潙妫滈妵鎰板即閻樼數鐓佺紓浣告湰濡炶棄螞閸ф绀嗛柛鈩冡缚閳ь兛绮欓弫宥夋晸閿燂拷
濠电偛妫庨崹鑲╂崲鐎n偆鈻旈悗锝庡幗缁佺櫉wist闂侀潧妫楅敃锝囩箔婢舵劕妫樻い鎾跺仜缂嶄線鏌涢弽銊у⒈婵炲牊鍘ISPR缂備焦绋掗惄顖炲焵椤掆偓椤︿即鎮ч崫銉ゆ勃闁逞屽墴婵″鈧綆鍓氶弳鈺呮倵濞戞瑥濮冮柛鏃撴嫹
闂佸憡顨嗗ú婊呭垝韫囨稒鍤勯柣鎰嚟閵堟挳骞栭弶鎴犵闁告瑥妫濆濠氬Ω閵夛絼娴烽柣鐘辩劍瑜板啴鎮ラ敓锟� - 濠电儑绲藉畷顒勫矗閸℃ḿ顩查柛鈩冾嚧閹烘挾顩烽幖杈剧秵閸庢垵鈽夐幘顖氫壕婵炴垶鎼╂禍婊冪暦閻旇櫣纾奸柛鈩冭壘閸旀帡鎮楅崷顓炰槐闁绘稒鐟ч幏瀣箲閹伴潧鎮侀梺鍛婂笧婢ф寮抽悢鐓庣妞ゆ柨鐏濈粣娑㈡煙鐠ㄥ鍊婚悷銏ゆ煕濞嗘ê鐏ユい顐㈩儔瀹曠娀寮介顐e浮瀵悂鏁撻敓锟�
婵炴垶鎸搁鍫澝归崶顒€违濠电姴瀚惌搴ㄦ煠瀹曞洤浠滈柛鐐存尦閹藉倻鈧綆鍓氶銈夋偣閹扳晛濡虹紒銊у閹峰懎饪伴崘銊р偓濠氭煛鐎n偄濮堥柡宀€鍠庨埢鏃堝即閻樿櫕姣勯柣搴㈢⊕閸旀帡宕濋悢鐓幬ラ柨鐕傛嫹