
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
猕猴桃AcBAM基因家族全基因组鉴定及其在淀粉代谢中的调控机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月03日 来源:BMC Plant Biology 4.3
编辑推荐:
为解决猕猴桃采后淀粉降解机制不明的问题,江西省科学院生物资源研究所团队通过全基因组分析鉴定出17个AcBAM基因,发现AcBAM5/13受ABA信号诱导并通过VIGS实验证实其调控淀粉降解的关键作用。该研究发表于《BMC Plant Biology》,为果实采后品质调控提供新靶点。
研究采用HMMER软件基于PF01373结构域鉴定基因家族,通过Expasy分析蛋白理化性质,运用MEGA X构建系统发育树,结合PlantCARE预测启动子顺式元件。采集江西省宜春市猕猴桃基地果实,设置常温/ABA/低温处理组,利用RNA-seq和qPCR分析表达模式,并通过病毒诱导基因沉默(VIGS)验证基因功能。
基因组分析揭示猕猴桃含有17个AcBAM基因,显著多于拟南芥等物种。系统发育分析将其分为3组,其中Group III的AcBAM5/13在采后8天表达量最高(FPKM>4000)。启动子分析发现这些基因含多个ABA响应元件(ABRE),实验证实ABA处理36小时后其表达显著上调。VIGS沉默AcBAM5/13导致叶片淀粉含量增加41%,证实其降解淀粉的功能。低温处理诱导AcBAM2表达量提升千倍,暗示温度调控路径的多样性。
值得注意的是,6个AcBAM基因的催化位点Glu380发生E→Q突变,可能丧失酶活性。共线性分析显示串联复制(AcBAM14/16)和片段复制(如AcBAM1/2/4)共同驱动基因家族扩张。与苹果基因组比较发现21对共线性基因,揭示两者较近的进化关系。
该研究首次在猕猴桃中建立BAM基因家族与淀粉代谢的调控网络,阐明AcBAM5/13通过ABA信号通路调控采后淀粉转化的分子机制。发现低温响应型AcBAM2为采后贮藏技术开发提供新思路。非典型BAM基因的鉴定为植物酶功能进化研究开辟新视角。研究成果对优化猕猴桃采后处理工艺、改善果实风味品质具有重要应用价值。
生物通微信公众号
知名企业招聘