第二配位层调控纳米酶抑制作用助力早期药物发现:开启药物研发新征程

《Nature Communications》:Second coordination sphere regulates nanozyme inhibition to assist early drug discovery

【字体: 时间:2025年04月02日 来源:Nature Communications

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  在早期药物发现中,天然酶存在获取困难、成本高及易受环境影响等问题。研究人员开展了关于设计具有特定第二配位层纳米酶(CuNC - OH)的研究。结果表明,该纳米酶能特异性识别抗甲状腺药物,且基于此建立的纳米酶辅助药物发现试剂盒(NDDK)可降低成本。这为早期药物发现提供了新途径。

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  在药物研发的漫长道路上,早期药物发现阶段至关重要,但却面临着诸多难题。传统的基于酶的药物筛选方法,依赖天然酶进行酶抑制分析以识别和分类抑制剂,进而理解药物作用机制。然而,天然酶存在着难以分离和纯化的问题,导致其价格昂贵,产量低且质量参差不齐,很多酶甚至在市场上难以获取。同时,蛋白质骨架对温度、pH 等环境因素极为敏感,酶的变性不仅增加了成本,还影响了检测结果的可靠性。因此,寻找先进的酶替代物辅助早期药物发现迫在眉睫。
在此背景下,华中师范大学的研究人员展开了深入研究。他们致力于设计一种新型纳米酶,期望通过对纳米酶结构的优化,使其能够更有效地模拟天然酶的功能,为早期药物发现提供更高效、低成本的解决方案。最终,研究人员成功制备出具有原子分散 Cu - N4位点且近端带有羟基的纳米酶(CuNC - OH),并在此基础上建立了纳米酶辅助药物发现试剂盒(NDDK)。这一成果发表在《Nature Communications》上,为药物研发领域带来了新的曙光。

研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。在材料表征方面,使用透射电子显微镜(TEM)、高分辨率透射电子显微镜(HR - TEM)、高角度环形暗场扫描透射电子显微镜(HAADF - STEM)结合能量色散光谱(EDS)以及 X 射线吸收光谱(XAS)等技术,对纳米酶的结构和电子态进行了详细分析。通过电子顺磁共振(EPR)和原位衰减全反射傅里叶变换红外光谱(ATR - FTIR)研究纳米酶的催化过程。利用基于密度泛函理论(DFT)的计算方法,深入探究第二配位层对纳米酶活性的影响。此外,还运用了微流控芯片技术和机器学习算法,用于药物筛选和数据分析。

下面来看具体的研究结果:
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  1. 纳米酶的合成与表征:研究人员采用盐模板策略合成 CuNC - OH。TEM 和 HR - TEM 图像显示其具有超薄纳米片结构且无聚集物种,HAADF - STEM 和 EDS 图像表明各元素均匀分散。FTIR 光谱和 XPS 分析证实了硝酸处理后引入了更多 - OH,XAS 研究显示 - OH 的引入未影响 Cu 的电子结构,但改变了第二配位层。
  2. 过氧化物酶样活性表征:以 3,3’,5,5’ - 四甲基联苯胺(TMB)为显色剂检测纳米酶的过氧化物酶样活性。CuNC - OH 对 H2O2的亲和力更强,其单位 Cu 位点的比活性比 CuNC 高 7.19 倍。EPR 和 ATR - FTIR 研究表明,CuNC - OH 和 CuNC 的催化过程遵循类似机制,但近端羟基影响了 H2O2的吸附和活化。DFT 计算进一步揭示,近端羟基通过改善 H2O2的吸附和活化来提高 Cu - N4位点的过氧化物酶样活性。
  3. 过氧化物酶样活性的抑制作用:以半胱氨酸(Cys)和甲巯咪唑(MMI)为模型抑制剂,研究第二配位层对纳米酶抑制作用的调节功能。XPS 光谱和动力学实验表明,CuNC - OH 对 MMI 表现出更特异性的抑制行为,而对 Cys 的抑制作用较弱。DFT 计算显示,近端羟基增强了 MMI 的吸附,从而影响了纳米酶的抑制效果。
  4. 抗甲状腺药物的初步筛选应用:为解决传统酶基药物发现试剂盒(EDDK)成本高的问题,研究人员开发了 NDDK,并结合微流控芯片和机器学习算法,对多种抗甲状腺药物进行筛选和分类。结果显示,NDDK 能够准确区分抗甲状腺药物和其他分子,在盲测中成功筛选出潜在的抗甲状腺药物,且成本显著降低。此外,NDDK 还可用于药物质量检测。

研究结论和讨论部分指出,该研究成功制备了具有工程化第二配位层的 CuNC - OH 纳米酶,其近端羟基类似于天然酶口袋中的氨基酸,优化了 H2O2的吸附构象,使过氧化物酶样活性大幅提高,并对抗甲状腺药物具有更特异性的结合能力。基于此开发的 NDDK,结合机器学习算法,可在早期药物发现的初级筛选阶段有效降低成本,同时还能用于商业药片的质量检测。该研究强调了纳米酶抑制作用及第二配位层设计的重要性,为纳米酶在药物发现领域的广泛应用提供了范例,有望推动整个药物研发行业的发展,开启早期药物发现的新篇章。

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