"UltraSelex:单步筛选技术革新RNA适配体发现,助力药物开发与活细胞成像"
《Nature Chemical Biology》:Single-step discovery of high-affinity RNA ligands by UltraSelex
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时间:2025年04月01日
来源:Nature Chemical Biology 13
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"传统SELEX技术筛选RNA适配体(aptamers)耗时费力且易产生偏差。研究人员开发出UltraSelex技术,通过生化分选、高通量测序和计算模型排名,仅需1天即可获得高亲和力RNA适配体。该技术成功筛选出结合硅罗丹明染料的荧光RNA适配体(用于活细胞成像)及靶向SARS-CoV-2 RdRp和HIV逆转录酶的抑制性适配体,为快速开发诊断工具和药物候选分子提供新范式。"
核酸适配体(aptamers)作为能特异性结合靶分子的"化学抗体",在药物开发、生物传感和纳米技术等领域应用广泛。传统指数富集配体系统进化技术(SELEX)虽有效但存在迭代周期长、易受非特异性富集干扰等缺陷。研究者突破性开发出UltraSelex技术,整合三大创新模块:1)生化分区实现高效靶标捕获;2)高通量测序获取海量序列数据;3)信噪比计算建模进行智能排序。该技术仅用24小时即成功筛选出三类高价值RNA适配体:能激活硅罗丹明(silicon rhodamine)荧光团的"分子开关"适配体(实现亚细胞级RNA动态追踪)、靶向新冠病毒RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)和HIV逆转录酶(RT)的高效抑制剂(解离常数达纳摩尔级)。通过序列特征分析还可快速推导最小功能基序。这项突破不仅将适配体开发周期从数月压缩至单日,更开辟了传染病治疗、肿瘤诊断等领域的精准分子工具开发新路径。
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