生菜（Lactuca sativa var. ramosa Hort）叶绿体基因组全序列解析及其系统发育研究：解锁蔬菜遗传密码，探寻进化奥秘

为探究生菜（Lactuca sativa var. ramosa Hort）的遗传信息及进化关系，研究人员对其叶绿体（cp）基因组进行测序与组装。结果显示，该 cp 基因组长度为 152,765 bp ，编码 133 个基因。此研究为开发分子标记和理解进化关系提供了重要资源。

　　生菜（Lactuca sativa var. ramosa Hort）是一种重要且广受欢迎的叶菜，具有极高的营养价值和经济价值。在这项研究中，对生菜（L. sativa var. ramosa）的整个叶绿体（cp）基因组进行了测序和组装。生菜（L. sativa var. ramosa）的 cp 基因组长度为 152,765 bp，包含一个大单拷贝区（LSC，84,103 bp）、一个小单拷贝区（SSC，18,596 bp）以及两个反向重复区（IR_a和 IR_b，均为 25,033 bp）。注释表明，生菜（L. sativa var. ramosa）的 cp 基因组编码 133 个基因，其中包括 87 个蛋白编码基因（PCGs）、37 个 tRNA 基因、8 个 rRNA 基因和 1 个假基因。共鉴定出 45 个分散重复序列和 191 个简单序列重复（SSRs），且分析发现 SSRs 中最丰富的类型是 A/T 单核苷酸。筛选出 5 个高变区（rps12、ycf3、petG、ycf1 和 ycf15）作为潜在的 cp 标记。系统分析了生菜（L. sativa var. ramosa）与其他 6 种莴苣属物种之间的 IR 边界。系统发育分析结果显示，生菜（L. sativa var. ramosa）与 L. sativa cv Salinas 的亲缘关系最为密切。这些研究结果提供了生菜（L. sativa var. ramosa）完整的 cp 基因组，为开发分子标记和理解进化关系提供了资源。