探秘前列腺癌体细胞遗传驱动因素：全基因组分析开启新征程

《GeroScience》：Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis

为探索散发性前列腺癌（PCa）的体细胞遗传驱动因素，研究人员开展了全基因组分析研究。他们整合多个数据集，鉴定出 150 个与 PCa 有因果关联的基因，其中 MSMB 基因尤为关键。该研究为 PCa 发病机制提供新视角，助力药物研发。

　　鉴于遗传性前列腺癌（PCa）仅占 PCa 表型的一小部分，探索导致散发性 PCa 的体细胞遗传驱动因素仍任重道远。研究人员从基因型组织表达（GTEx）数据集获取前列腺特异性基因的表达数量性状位点（eQTLs）数据，收集了 5854 个基因的汇总统计信息。从三个成熟的联盟（英国生物银行 9131 例病例和 173493 例对照、前列腺癌风险基因关联研究（PRACTICAL）79148 例病例和 61106 例对照、芬兰基因队列 13216 例病例和 119948 例对照）提取与 PCa 的遗传关联。为确定潜在因果靶点的优先级，研究人员进行了额外分析，包括蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）、癌症基因组图谱（TCGA）数据集和单细胞类型表达分析。总体而言，共鉴定出 150 个与 PCa 具有相同因果关联的常见显著基因。在检测的 150 个基因中，67.33%（101/150）具有蛋白质编码功能，而这些基因中只有 30.67%（46/150）在科学文献中曾被提及。值得注意的是，TCGA 数据集的分析显示，只有 44.67%（67/150）的基因与孟德尔随机化（MR）分析结果一致。此外，单细胞 RNA 测序数据评估和共定位分析筛选出 MSMB 作为与 PCa 发生相关的关键基因。研究人员确定了一系列与 PCa 发病具有因果关联的前列腺特异性基因。其中，MSMB 基因成为与 PCa 相关的关键因素，在 MR、TCGA 数据集、单细胞 RNA 测序数据和共定位分析这四项评估中均表现出高度一致性。这些发现为 PCa 的发病机制提供了新视角，并为药物开发提供了潜在靶点。