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为探究如何调控金属酶外球相互作用影响其功能,研究人员设计了新型人工铜蛋白(ArCuPs)。通过对比 3SCC 和 4SCC,发现 4SCC 因溶剂重组能高而无 C-H 过氧化活性,破坏特定氢键可恢复其活性。该研究为金属酶设计提供新思路。
在生命的微观世界里,金属酶扮演着至关重要的角色,它们参与了呼吸、电子转移(ET)、生物质降解等众多生化过程。然而,想要精准控制金属酶外球相互作用来影响其功能,却如同在错综复杂的迷宫中寻找出口,充满挑战。就拿含铜(Cu)的金属蛋白来说,不同的 Cu 中心结构,像类型 1 Cu 中心仅参与电子转移,类型 2 Cu 蛋白则可参与电子转移或催化,但其活性位点在不同蛋白质矩阵中的表现差异极大,使得人们难以弄清楚配位环境、远程相互作用等因素究竟如何影响电子转移、溶剂重组能(
λ)以及对
H2O2/
O2的反应性,进而决定金属酶的最终功能。在这种背景下,来自美国密西西比大学(University of Mississippi)等机构的研究人员,踏上了探索之旅,开展了一项旨在揭示金属酶功能调控机制的研究。
研究人员巧妙地设计了人工铜蛋白(ArCuPs),构建了具有不同配位结构的三聚体(3SCC)和四聚体(4SCC)自组装体。其中,3SCC 中的 Cu 以三角Cu(His)3配位,4SCC 中的 Cu 则是四方锥Cu(His)4(OH2)配位。他们通过一系列实验研究,得出了令人瞩目的结论。研究发现,3SCC 能够高效地电催化 C-H 氧化,而 4SCC 却没有这种活性。进一步研究表明,4SCC 的无活性是由于特定的 His---Glu 氢键介导了较高的溶剂重组能障碍。当这个氢键被破坏后,溶剂重组能降低,4SCC 竟然恢复了 C-H 过氧化活性。这一发现就像是找到了一把钥匙,能够开启或关闭金属酶的功能,为理解金属酶的作用机制和设计新型金属酶提供了全新的视角,意义重大。该研究成果发表在《Nature Communications》上,为该领域的发展注入了新的活力。
为了开展这项研究,研究人员运用了多种关键技术方法。在结构解析方面,利用 X 射线晶体学技术,成功解析了 4SCC 和相关突变体的晶体结构,直观地观察到蛋白质的空间构象和原子配位情况。光谱技术也发挥了重要作用,如 UV-vis 光谱和 EPR 光谱,用于监测金属酶在反应过程中的电子转移和氧化态变化,获取其电子结构信息。此外,电化学方法,包括蛋白质膜伏安法、旋转圆盘电化学(RDE)和计时电流法(CA),用于测定金属酶的氧化还原性质和重组能,从电化学角度深入探究其反应机制 。
下面来详细看看研究结果:
- 模块化肽组装设计:研究人员利用从头设计蛋白质的方法,通过控制七肽重复序列((abcdefg))中 a 和 d 位点的疏水残基(如 Ile 和 Leu),成功构建了 3SCC 和 4SCC 自组装体。这种设计策略就像是搭建乐高积木一样,通过改变不同的模块,实现了对蛋白质寡聚状态和活性位点配位环境的精准调控,为后续研究奠定了坚实基础。
- 4SCC 的结构和电子性质:X 射线晶体学分析显示,4SCC 呈现出预期的四聚体结构,Cu 与四个 His 配位形成近似四方锥的Cu(His)4OH2结构。电子光谱和 EPR 光谱进一步揭示了其电子结构特征,表明 4SCC 具有高度的结构均一性,为理解其反应活性提供了结构依据。
- 3SCC 和 4SCC 的反应性差异:电化学实验表明,3SCC 能够有效地催化H2O2还原和苄基 C-H 底物的氧化、过氧化反应,而 4SCC 则几乎没有这些活性。这一差异表明,金属配位环境的改变对 ArCuPs 的反应性有着决定性影响,就像不同的钥匙只能打开特定的锁一样。
- 3SCC 比 4SCC 更容易还原:通过 Trp 荧光监测 Cu 的氧化态变化,研究人员发现 3SCC 被抗坏血酸(Asc)还原的速度比 4SCC 快得多。这一结果与它们的配位结构密切相关,说明Cu(His)3结构更有利于容纳还原态的 Cu,进一步解释了两者反应活性差异的原因。
- H2O2和O2依赖的再氧化:研究人员分别用H2O2和O2对还原态的 ArCuPs 进行再氧化实验。结果显示,3SCC 与H2O2反应更快,生成多种 Cu - 氧物种;与O2反应则相对较慢。而 4SCC 与两者反应都很缓慢,活性较低,这与 pMMO 中CuB位点的惰性相似,暗示了它们可能存在相似的反应机制。
- ArCuPs 的氧化还原性质:蛋白质膜伏安法测定结果显示,3SCC 和 4SCC 的氧化还原电位(E°)相近,但 4SCC 的循环伏安曲线更宽,表明其电子转移速度较慢,这与之前观察到的反应活性差异相呼应。
- 4SCC 比 3SCC 具有更高的λ值:通过 RDE 和 CA 两种电化学方法,研究人员测定了 ArCuPs 的重组能。结果发现,4SCC 的总重组能(λT)明显高于 3SCC,且其溶剂重组能(λH2O)占比很大。这是因为 4SCC 中存在由 His 和 Glu 形成的氢键,以及由此介导的扩展水分子氢键网络,增加了结构刚性和重组能,从而降低了反应活性。
- 删除氢键相互作用调节λH2O并实现 C-H 氧化:为了验证能否通过改变氢键来调节重组能,研究人员设计了 K6E/E8K-4SCC 突变体,删除了 4SCC 中的 Glu-His 氢键。实验结果表明,突变体的λH2O显著降低,同时恢复了对苄基醇的过氧化活性,证明了通过调节氢键可以调控金属酶的活性。
研究结论和讨论部分指出,通过调节疏水层的 Ile/Ile 到 Leu/Ile 转换,成功调控了 ArCuPs 的寡聚化行为。3SCC 和 4SCC 在还原、再氧化以及催化活性方面存在显著差异,这些差异可归因于内球和外球重组能与结构差异的相互作用。4SCC 中扩展的水分子氢键网络导致其高重组能和低反应活性,而破坏特定氢键能够降低溶剂重组能,使原本无活性的 4SCC 转变为有活性的过氧化催化剂。这一发现为金属酶设计提供了新的策略,即通过精确控制外球溶剂重组能来调节金属酶的活性,有望在生物催化、生物能源等领域得到广泛应用,推动相关领域的发展,为解决实际问题提供新的思路和方法。