《Scientific Reports》:Deciphering the tumor-suppressive role of RBMS3 in lung adenocarcinoma through genomic insights into prognosis and mechanisms
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肺癌腺癌(LUAD)死亡率高,现有疗法受限。研究人员开展关于 RBMS3 在 LUAD 中作用的研究,发现 RBMS3 是抑癌基因,与患者生存相关,还能调节免疫微环境。这为 LUAD 预后判断和治疗提供新方向。
肺癌,这个隐匿在暗处的 “健康杀手”,长期以来严重威胁着人类的生命健康。在各类癌症相关死亡原因中,肺癌一直名列前茅,其中肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)又是肺癌的主要类型之一 。尽管现代医学在肺癌治疗方面取得了一定进展,像手术、放疗、化疗、靶向治疗以及免疫检查点抑制剂(ICIs)等多种治疗手段不断涌现,但肺癌患者的预后情况依旧不容乐观。一方面,现有诊断方法很难在肺癌早期发现病变,导致许多患者确诊时已处于中晚期;另一方面,治疗过程中出现的耐药问题使得治疗效果大打折扣,患者的 5 年总生存率始终处于较低水平。因此,寻找新的生物标志物和治疗靶点迫在眉睫,这不仅关系到提高肺癌患者的生存率,还关乎改善他们的生活质量。
在这样的背景下,昆明医科大学第二附属医院等研究机构的研究人员开展了一项关于 RBMS3 在肺腺癌中作用的研究。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为肺腺癌的治疗和预后判断带来了新的希望。
研究人员为深入探究 RBMS3 在肺腺癌中的作用,运用了多种关键技术方法。首先,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)获取 RNA 测序数据和临床信息,进行数据收集。然后,利用 R 语言相关软件包进行差异表达分析,筛选出差异表达基因(DEGs)。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定与肺腺癌相关的关键模块。此外,还进行了功能富集分析、构建预后模型评估 RBMS3 与患者生存关系,借助免疫细胞浸润分析探究其与免疫细胞的关联,最后通过细胞培养、转染等细胞实验对生物信息学分析结果进行验证。
在研究结果方面,主要有以下发现:
- 关键基因的筛选:通过对 TCGA 数据库数据的分析,研究人员筛选出 4456 个差异表达基因,其中 RBMS2 和 RBMS3 被确定为共同差异表达的 RNA 结合基序(RBM)基因。进一步分析发现,RBMS3 在肺腺癌组织中显著下调,且其表达与肿瘤大小、淋巴结转移、远处转移以及临床分期呈负相关。
- 关键模块的确定:运用 WGCNA 分析,研究人员构建了基因共表达网络,确定了 38 个模块。其中,MEpink 模块与肺腺癌呈最强正相关,MEblue 模块与肺腺癌呈最强负相关。后续研究发现,RBMS3 位于 MEblue 模块中,且该模块中的基因与多种癌症相关信号通路密切相关。
- RBMS3 的预后价值:单因素和多因素 Cox 回归分析表明,RBMS3 表达与肺腺癌患者预后显著相关。基于 RBMS3 和其他临床因素构建的风险评分模型,能够有效将患者分为低风险和高风险组,且两组患者的总生存率存在显著差异。该模型的预测准确性较高,1 年、3 年和 5 年生存率的受试者工作特征曲线下面积(AUC)均超过 0.65。
- 免疫细胞浸润分析:研究人员利用 CIBERSORT 算法和 TIMER 工具分析免疫细胞浸润情况,发现 RBMS3 表达与多种免疫细胞浸润呈正相关,包括 B 细胞、CD8+T 细胞、CD4+T 细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞。这表明 RBMS3 可能在调节肿瘤免疫微环境中发挥重要作用。
- 细胞实验验证:在细胞实验中,研究人员发现 RBMS3 在肺腺癌细胞系中的表达明显低于正常细胞。过表达 RBMS3 能够显著抑制 A549 和 PC-9 细胞的增殖、侵袭和迁移能力,促进细胞凋亡,并加速细胞周期从 G1 期向 S 期的转变。
在研究结论和讨论部分,该研究明确了 RBMS3 在肺腺癌中的重要作用。RBMS3 作为一种关键的 RNA 结合蛋白,不仅在细胞周期调控、细胞凋亡和迁移过程中发挥重要的肿瘤抑制作用,还参与调节肿瘤免疫微环境,影响免疫细胞浸润。这一发现为肺腺癌的预后判断提供了新的生物标志物,也为开发新的治疗策略提供了潜在的靶点。然而,研究也存在一定的局限性,如数据来源可能存在人群特异性偏差,缺乏体内实验和更深入的临床研究等。未来的研究需要进一步扩大样本量,开展更多体内实验和临床验证,结合多组学技术深入探究 RBMS3 的分子机制,以推动肺腺癌精准治疗的发展,为改善患者的生存状况带来更多希望。
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