揭秘环状 RNA:调控海马神经元兴奋性突触形成的关键角色

《Nature Communications》:

【字体: 时间:2025年03月29日 来源:Nature Communications

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  在探究环状 RNA(circRNAs)于哺乳动物突触形成中的功能时,研究人员利用 RNA 干扰技术,对大鼠海马神经元兴奋性突触形成过程中 circRNAs 的作用展开系统研究。结果发现多个 circRNAs 可抑制兴奋性突触形成,其中 circRERE 通过稳定 miR-128-3p 发挥作用。这为深入理解突触发育调控机制提供了新视角。

  在神秘的大脑世界里,非编码 RNA(ncRNAs)正逐渐成为科学家们关注的焦点,它们在大脑的基因调控中发挥着越来越重要的作用。环状 RNA(circRNAs)作为 ncRNAs 的一种,以其独特的稳定性和封闭结构,在哺乳动物大脑中大量富集。然而,尽管 circRNAs 在神经系统中的转录组丰富多样,但绝大多数在哺乳动物神经元中表达的保守 circRNAs 的功能仍是未知的,就像隐藏在黑暗中的宝藏等待被发掘。
为了揭开这些神秘 circRNAs 的功能面纱,来自瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH Zürich)的研究人员勇挑重担,开展了一项意义非凡的研究。他们将研究重点聚焦于 circRNAs 在哺乳动物突触形成中的作用,旨在系统地探究其调控机制。研究成果发表在《Nature Communications》上,为该领域的发展带来了新的曙光。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先是 RNA 干扰(RNAi)技术,通过它来实现对特定 circRNAs 的靶向敲低,从而观察其对突触形成的影响。其次,RNA 测序(RNA-seq)技术也发挥了重要作用,帮助研究人员全面分析 circRNAs 的表达谱和基因调控网络。此外,荧光原位杂交(FISH)技术用于精准确定 circRNAs 在细胞内的定位,为深入了解其功能提供了有力支持。

下面让我们详细了解一下研究结果:

  • 海马神经元中 circRNA 景观的特征:研究人员利用之前建立的分区培养系统,对大鼠海马神经元进行研究。通过重新分析已发表的核糖体缺失转录组数据集,并进行 circRNA 重建,他们发现神经元 circRNAs 倾向于定位于神经元突起(轴突和树突)。进一步分析表明,这些 circRNAs 大多来源于突触基因,且部分含有较多的 miRNA 结合位点,这暗示着它们在突触发生和相关疾病中可能扮演重要角色。
  • RNAi 筛选揭示具有特定功能的 circRNAs:基于 RNA 测序结果,研究人员筛选出 30 个候选 circRNAs,并添加了已报道的具有 miRNA 调控功能的 circRNAs 进行研究。通过 RNAi 介导的敲低实验和免疫细胞化学分析,他们发现 7 种 circRNAs 可作为内源性抑制因子,抑制兴奋性突触的形成和维持。其中,circRERE2和 circPhf21a 对兴奋性突触共簇和树突棘的形成影响尤为显著,成为后续深入研究的重点对象。
  • circRERE 对兴奋性突触的双重调控作用:circRERE 基因位点可产生多种异构体,研究人员对其中最丰富的 circRERE2进行深入研究。敲低 circRERE 会导致突触共簇和树突棘密度增加,但同时会使微小兴奋性突触后电流(mEPSC)频率降低,这表明新形成的突触可能是无功能的 “沉默突触”。进一步研究发现,circRERE 抑制 GluA1 表达,但促进其膜定位,揭示了 circRERE 在兴奋性突触发育中的双重作用。
  • circRERE 通过稳定 miR-128-3p 发挥作用的机制:对敲低 circRERE 后的神经元进行转录组分析,研究人员发现 miR-128-3p 的靶基因显著上调。进一步实验表明,circRERE 能够稳定 miR-128-3p,敲低 circRERE 会导致 miR-128-3p 表达和活性降低。而过表达 miR-128-3p 可挽救 circRERE 敲低引起的突触表型,证明了 circRERE 对 miR-128-3p 的调控在突触形成中的关键作用。
  • circRERE 功能依赖于 miR-128-3p 结合位点:生物信息学分析预测 circRERE 含有两个高亲和力的 miR-128-3p 结合位点。研究人员构建了野生型和突变型 circRERE 过表达载体进行实验,结果表明 circRERE 对 miR-128-3p 的稳定作用及其对突触形成的调控依赖于这些结合位点,为揭示 circRERE 的作用机制提供了关键证据。

研究结论和讨论部分进一步强调了这些发现的重要意义。该研究首次系统地揭示了 circRNAs 在哺乳动物突触发生中的重要作用,尤其是 circRERE 通过稳定 miR-128-3p 来调控兴奋性突触形成的机制。这不仅为理解突触发育和功能的调控网络增添了新的重要信息,也为后续研究 circRNAs 在神经发育和精神疾病中的病理生理作用奠定了坚实基础。例如,研究发现 circRERE 与亨廷顿病(HD)、自闭症等神经发育障碍存在潜在关联,这为探索这些疾病的发病机制和治疗靶点提供了新的方向。

总的来说,这项研究为生命科学和医学领域关于 circRNAs 的研究开辟了新的道路,让我们对大脑中复杂的基因调控机制有了更深入的认识,有望为未来神经疾病的治疗带来新的希望和突破。

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