利用计算方法揭示杜氏利什曼原虫 3 - 巯基丙酮酸硫转移酶（Ld3-MST）结构奥秘：对药物设计及靶点特异性的重大意义

《In Silico Pharmacology》：Harnessing computational methods for uncovering structural insights into Leishmania donovani 3-MST: implications for drug design and target specificity

为探究利什曼原虫（Leishmania）中 3 - 巯基丙酮酸硫转移酶（3-MST）的作用及结构差异，研究人员开展了 Ld3-MST 与 Hs3-MST 结构对比研究。结果发现 Ld3-MST 结构独特，活性位点优势明显。该研究为开发精准的 Ld3-MST 抑制剂奠定基础。

　　3 - 巯基丙酮酸硫转移酶（3-Mercaptopyruvate sulfurtransferase，3-MST）在多种生物学过程中发挥着不可或缺的作用。在利什曼原虫（Leishmania）领域，3-MST 的作用却鲜少被深入探索。它是利什曼原虫在应激状态下维持氧化稳态以生存的关键角色，这使得 Ld₃-MST 成为极具潜力的药物靶点。然而，当一种蛋白质同时存在于宿主和寄生虫体内时，识别其结构差异就显得至关重要。本研究深入探究了 Ld₃-MST 和 Hs₃-MST 之间的结构差异，为药物设计提供了宝贵见解。Ld₃-MST 的显著特征是其延长的 70 个氨基酸的 C 末端，这主要形成了活性位点腔上方的类似盖子的结构域，使其区别于 Hs₃-MST。均方根偏差（Root Mean Square Deviation，RMSD）分析表明，其延伸的尾部导致了结构波动，而回旋半径（Radius of gyration，Rg）和溶剂可及表面积（Solvent Accessible Surface Area，SASA）证实了 Ld₃-MST 的开放性和溶剂可及性，尤其是在其活性位点，这表明它有能力容纳更大的分子。主成分（Principal Component，PC）和自由能景观（Free Energy Landscape，FEL）分析揭示了 Ld₃-MST 独特的内部分子动力学，特别是在活性位点。对接研究表明，Ld₃-MST 的活性位点能够有效容纳分子，突出了其作为药物靶点的潜力。这项全面的研究为开发具有前景治疗应用的精准 Ld₃-MST 抑制剂奠定了基础。