内布拉斯加盐沼分离的霍乱弧菌基因组携带多重抗生素耐药标记：环境耐药性传播的新警示

来自内布拉斯加的研究团队通过对盐沼环境分离的霍乱弧菌(Vibrio cholerae)进行全基因组测序，发现该菌株携带36种抗生素耐药标记(AMR)和100余种毒力因子。研究采用Illumina MiniSeq平台(2×150 bp)和Unicycler组装获得4.16 Mb完整基因组，经CheckM验证无污染。该发现证实多重耐药病原体可在偏远环境中自然存在，为环境微生物耐药性传播机制研究提供了重要线索。

　　科研人员从内布拉斯加林肯市附近的盐沼(40°52′54.42″N, 96°39′35.82″W)分离出一株独特的霍乱弧菌(Vibrio cholerae)NSM菌株。通过Illumina MiniSeq平台进行高通量测序，采用Unicycler(v0.4.8)组装获得4,160,897 bp的完整基因组，GC含量47.4%。令人警惕的是，基因组分析揭示该环境菌株携带36个抗生素耐药基因(包括四环素外排泵MFS)和百余种毒力因子，经BV-BRC平台比对VFDB和CARD数据库确认。与临床菌株ATCC 14035相比(ANI 97.7%)，该环境分离株展现出惊人的耐药基因储备，暗示自然环境可能是抗生素耐药性(AMR)的潜在储库。研究团队使用RCV培养基(含15 μg/L生物素和10 g/L NaCl)成功培养该菌株，并通过PGAP(v6.6)注释发现3,779个编码序列(CDS)和84个tRNA基因。这项发现为理解耐药基因在环境中的自然进化提供了关键证据。