LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 基因：肺腺癌 N0 分期诊断及预后评估的新希望

《Scientific Reports》：LINC00894, YEATS2-AS1, and SUGP2 genes as novel biomarkers for N0 status of lung adenocarcinoma

肺癌死亡率居高不下，肺腺癌（LUAD）是主要亚型且常晚期确诊。为探寻 LUAD 早期分子标志物，研究人员通过生物信息学和实验方法，对 LUAD 患者基因进行研究。结果发现 LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 可作为 N0 期 LUAD 的生物标志物，有助于改善诊断和治疗策略。

　　肺癌，这个 “癌症杀手”，在全球范围内都保持着极高的死亡率，而肺腺癌（LUAD）作为肺癌的主要亚型，更是让人头疼不已。它常常在悄无声息中发展到晚期，具有侵袭性强、转移早、复发率高的特点，严重威胁着人们的生命健康。目前，现有的诊断方法，像活检、纵隔镜检查和支气管镜检查，不仅耗时，还可能耽误治疗的最佳时机；低剂量 CT 扫描虽然是早期筛查的常用手段，但准确性欠佳，而且频繁使用会让患者暴露在辐射风险中；至于肿瘤标志物的组织学分析，比如癌胚抗原（CEA），其在肺癌患者体内会升高，但在其他肿瘤或疾病中同样也会升高，缺乏特异性。因此，寻找在肿瘤转移前就能检测到的分子生物标志物，对制定有效的治疗策略至关重要。

在这样的背景下，来自伊朗伊斯兰阿扎德大学卡泽伦分校、赞德高等教育学院等机构的研究人员，决心攻克这一难题。他们开展了一项关于 LUAD 在淋巴结转移前相关基因的研究，旨在找到与 LUAD 的 N0 状态（无淋巴结转移）相关的特定基因。最终，他们发现了 LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 基因在 N0 期 LUAD 中显著上调，并且这些基因可以作为生物标志物或预后标志物，这一发现为 LUAD 的早期诊断和治疗提供了新的方向，该研究成果发表在《Scientific Reports》上。

为了开展这项研究，研究人员采用了多种关键技术方法。他们从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载了 LUAD 患者的 RNA 测序数据和临床数据，并利用 R 软件和相关包进行数据处理和分析；通过实时荧光定量 PCR（qRT-PCR）技术对候选基因的表达进行验证；运用 RNA 干扰（shRNA）技术敲低 LINC00894 基因，探究其对细胞功能的影响。

研究结果如下：

• N0 特异性差异表达基因（DEGs）的鉴定：研究人员通过对 TCGA 数据库中数据的分析，筛选出了 278 个在 N0 状态下相对于正常样本和 N + 样本均显著上调的基因，以及 43 个显著下调的基因，这些基因被视为后续分析的候选基因。
• N0 期 LUAD 特异性 ceRNA 子网的鉴定：在这些候选基因中，大部分是长链非编码 RNA（lncRNA）。研究人员构建了 ceRNA 网络，发现其中 9 个 lncRNA 具有最高的连接度，并分析出 PI3K/AKT/mTOR 通路在该网络中得分最高。
• 选定基因在 LUAD 组织样本中的表达验证：通过 qRT-PCR 检测，发现 LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 基因在 N0 期 LUAD 组织中的表达显著高于正常组织，而 ANKRD10-IT1、hsa-let-7a-5p、miR-423-5p、hsa-let7e-5p 和 MDM4 基因的表达情况与生物信息学分析结果不一致。
• 选定基因在 N0 期 LUAD 中的诊断和预后价值：ROC 曲线分析表明，LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 基因可作为 N0 期 LUAD 的优秀生物标志物；生存分析显示，LINC00894 和 SUGP2 基因高表达的患者 5 年生存率较低。
• LINC00894 基因敲低及其对细胞迁移、侵袭和凋亡的影响：敲低 LINC00894 基因后，Calu-3 细胞的迁移和侵袭能力显著降低，早期凋亡率显著增加。

研究结论和讨论部分指出，LUAD 预后差，寻找新的生物标志物意义重大。研究人员发现的 LINC00894、YEATS2-AS1 和 SUGP2 基因在 N0 期 LUAD 中发挥着重要作用。虽然目前对这些基因的具体生物学功能和分子机制了解有限，但它们作为生物标志物的潜力巨大。未来可以进一步对 lncRNA - miRNA - mRNA 轴进行实验评估，开展体内实验验证结果。这项研究为 LUAD 的早期诊断和治疗提供了重要线索，有望推动相关领域的发展，改善患者的预后。