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SARS-CoV-2主蛋白酶与安贝氯铵的体外酶学和细胞培养相互作用研究:一种潜在的双重调节机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年03月28日 来源:Scientific Reports 3.8
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本研究针对COVID-19治疗中3CLpro靶向药物开发难题,由巴西联邦大学团队通过酶动力学、细胞毒性及抗病毒实验结合分子对接技术,首次发现抗重症肌无力药物安贝氯铵(ambenonium)在低浓度(0.1-0.01μM)可减少病毒蚀斑形成,高浓度(1-100μM)却增强3CLpro活性,揭示其作为病毒活性双重调节剂的独特作用模式,为抗冠状病毒药物设计提供新思路。
新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情席卷全球之际,科学家们争分夺秒地寻找对抗SARS-CoV-2的有效武器。在这场与病毒的赛跑中,病毒自身的"分子剪刀"——3CL主蛋白酶(3CLpro)因其在病毒复制中的关键作用成为热门靶点。传统药物开发耗时耗力,而"老药新用"策略为抗击疫情提供了快速通道。正是在这样的背景下,巴西联邦大学的研究团队将目光投向了临床用于治疗重症肌无力的安贝氯铵(ambenonium),这项突破性研究发表在《Scientific Reports》上。
研究团队采用多学科交叉方法:通过3CL蛋白酶MBP-tag检测试剂盒进行酶动力学分析,测定不同浓度安贝氯铵对酶活性的影响;使用Vero CCL-81和HEK-293细胞系进行细胞毒性评估和抗病毒实验,通过蚀斑形成试验和qRT-PCR定量病毒基因组拷贝数;运用AutoDock Vina进行分子对接,NAMD软件进行100 ns分子动力学(MD)模拟,分析蛋白质-配体相互作用。
"安贝氯铵对3CLpro的影响"部分揭示了出人意料的现象:在100μM至1μM浓度范围内,安贝氯铵非但没有抑制反而增强了3CLpro的活性,表现为Vmax和Km同步降低的双重调节模式。而在0.1-0.01μM低浓度时,却能显著减少病毒蚀斑形成,这种浓度依赖性双向调节作用在病毒蛋白酶抑制剂中极为罕见。
"哺乳动物细胞毒性和抗SARS-CoV-2活性实验"证实安贝氯铵在测试浓度范围内对Vero和HEK细胞均无显著毒性。特别值得注意的是,低浓度安贝氯铵处理组的病毒基因组拷贝数明显低于对照组,而高浓度组反而出现病毒复制增强现象,这与蚀斑实验结果相互印证,强化了其作为病毒活性调节剂的证据链。
"分子对接和分子动力学模拟"显示安贝氯铵与3CLpro单体和二聚体均能结合,但结合自由能分析表明其与单体形式的相互作用更强(-6.6 kcal/mol vs 二聚体-5.4 kcal/mol)。分子动力学轨迹分析发现,安贝氯铵主要通过与催化残基CYS145、HIS41等形成氢键来稳定蛋白质-配体复合物,这种结合模式可能通过影响酶的二聚化过程来调节其活性。
这项研究首次系统揭示了安贝氯铵对SARS-CoV-2主蛋白酶的独特调节作用,其浓度依赖性的双向效应为理解宿主-病毒相互作用提供了新视角。虽然安贝氯铵本身可能不适合直接作为抗COVID-19药物,但其特殊的调节机制为开发新型3CLpro变构调节剂指明了方向。该研究还凸显了酶动力学研究中"分子拥挤效应"的重要性,提示体外实验结果向体内转化的复杂性。从转化医学角度看,这项发现不仅拓展了我们对冠状病毒蛋白酶调控机制的认识,也为应对未来可能出现的冠状病毒新变种储备了重要的基础研究数据。
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