基于EM算法的亲缘关系分析工具EMIBD9：九项浓缩IBD系数与近交系数的精准估算

为解决小样本或高亲缘性群体中传统方法估算等位基因频率不准确的问题，研究人员开发了EMIBD9程序。该工具采用期望最大化(EM)算法，通过基因型数据精准估算个体间九项浓缩IBD系数Δ = {Δ1,...,Δ9}，并据此计算近交系数和亲缘系数(kinship coefficient)，为群体遗传学研究提供可靠分析手段。

　　EMIBD9作为创新型计算工具，通过两种似然法实现九项浓缩血缘同源(Identity by Descent, IBD)系数Δ = {Δ₁, Δ₂, ..., Δ₉}的精准估算。特别针对含高比例近亲的小样本群体，突破传统方法依赖大样本非近交群体的局限，采用期望最大化(Expectation Maximization, EM)算法动态优化等位基因频率及其幂次乘积的估计值。基于所得Δ参数，可准确推导个体近交系数及亲缘相关度(kinship coefficient)，为复杂家系分析和群体遗传结构解析提供关键技术支持。