RUNX1 生殖系拷贝数变异：更新病例报告及十年误诊迷雾背后的研究意义

《BJC Reports》：Germline copy number variants in RUNX1: An updated case report and a decade-old red herring

为解决遗传性血小板疾病及相关髓系恶性肿瘤（FPDMM）的误诊问题，研究人员对一个有血液系统疾病家族进行研究。重新评估发现 RUNX1 基因外显子 5 - 6 缺失，而非之前认为的 GATA2 缺陷。这一结果有助于准确诊断和疾病监测，意义重大。

　　在血液疾病的研究领域，遗传性血小板疾病及相关髓系恶性肿瘤（Familial platelet disorder with associated myeloid malignancies，FPDMM）一直是备受关注的焦点。FPDMM 是一种常染色体显性遗传病，由 RUNX1 基因的有害变异引起，患者不仅存在血小板数量和质量的缺陷，而且一生中有 35 - 45% 的概率患造血系统恶性肿瘤。RUNX1 基因编码一种关键的造血转录因子，在细胞周期调控和胚胎发育中起着重要作用。然而，由于一些基因变异的表型相似，使得准确诊断面临诸多挑战。例如，ETV6、ANKRD25、DDX41 等基因变异也与造血系统恶性肿瘤易感性相关，且 ETV6 和 ANKRD26 的致病性 / 可能致病性（Pathogenic/Likely pathogenic，P/LP）生殖系变异与 FPDMM 的许多方面相似，尤其是先天性血小板减少症，这就容易造成误诊。另外，GATA2 基因同样编码造血转录因子，GATA2 缺陷会导致多种表型，包括免疫缺陷、淋巴水肿、肺部病变、先天性耳聋以及早发造血系统恶性肿瘤的高风险，其与 FPDMM 在某些症状上也存在重叠，进一步增加了诊断的复杂性。因此，如何准确识别这些疾病，避免误诊，成为亟待解决的问题。

为了攻克这一难题，美国国立卫生研究院（National Institutes of Health，NIH）国家人类基因组研究所肿瘤发生与发展科、华盛顿大学医学院实验室医学与病理学系、南澳大利亚州病理学与南澳大学癌症生物学中心等机构的研究人员展开了一项深入研究。研究人员重新评估了一个家族的病例，最终得出结论：之前被误诊为 GATA2 缺陷的病例，实际上是 RUNX1 基因外显子 5 - 6 缺失导致的 FPDMM。这一发现不仅纠正了之前的错误诊断，还为家族成员的疾病监测和预防提供了重要依据。该研究成果发表在《BJC Reports》上，为相关领域的研究开辟了新的方向。

在研究过程中，研究人员主要运用了以下关键技术方法：首先是下一代测序（Next generation sequencing，NGS）技术，对患者的肿瘤样本和生殖系样本进行检测，分析基因变异情况；其次是对家族成员进行级联检测（Cascade testing），追踪变异基因在家族中的遗传情况；此外，还通过对培养的皮肤成纤维细胞进行 DNA 检测，以确定生殖系的基因变异。这些技术方法相互配合，为研究提供了有力支持。

研究结果如下：

• 病例重新评估：2011 年，一名 50 岁女性被诊断为伴有 7 号染色体单体的急性髓系白血病（Acute myeloid leukemia，AML），当时分子检测发现其血液中存在两个 GATA2 基因的生殖系变异（p.Thr358Lys 和 p.Leu359Val），因此被认为是 GATA2 缺陷。但她长期存在血小板减少症，这在 GATA2 缺陷中并不典型。12 年后，她的哥哥被诊断为骨髓增生异常综合征（Myelodysplastic syndrome，MDS），对其进行 NGS 检测发现了 RUNX1 基因外显子 5 - 6 的缺失，而之前在妹妹身上发现的 GATA2 变异并未出现。
• 家族级联检测：对家族进行级联检测后发现，RUNX1 基因变异与家族中出现血小板减少、异常出血和瘀伤的个体相关。一名携带该变异的兄弟因突发脑出血死亡，这是 FPDMM 的一种罕见但已知的并发症。通过家族遗传分析，确定最初的患者也是 RUNX1 基因缺失的携带者，之前未检测到该缺失是因为当时未对拷贝数变异（Copy number variants，CNVs）进行评估。
• CNVs 的重要性：研究发现 CNVs 在 RUNX1 - FPDMM 中很常见，在 NIH 的 RUNX1 自然史研究中，超过 25% 的报告变异是 CNVs。部分 CNVs 可出现在 RUNX1 基因的各个位置，包括部分重复和缺失，甚至整个基因的缺失。临床检测中常遗漏 CNVs，尤其是最初检测为体细胞突变面板时，容易导致诊断延迟或漏诊。

研究结论和讨论部分强调了以下重要意义：一方面，该研究突出了全面分子评估和仔细变异解读的重要性，特别是对于 CNVs 的评估。在临床怀疑为 RUNX1 - FPDMM 的病例中，必须对 CNVs 和内含子变异进行评估。另一方面，该研究表明持续和彻底评估家族疾病的重要性。7 号染色体单体虽然是 GATA2 缺陷的标志性特征，但也在 RUNX1 - FPDMM 病例中出现过。此外，虽然最初患者的 GATA2 变异在其恶性肿瘤中的作用尚未确定，但最终是 RUNX1 基因变异与疾病相关，这体现了级联检测在证实疾病风险关联方面的重要性。总之，这项研究通过重新评估家族病例，借助新的测序技术实现了更准确的诊断，使家族成员能够进行疾病的主动监测，为临床诊断和治疗提供了重要参考，对相关领域的研究和实践具有深远的影响。