CRISPRi 助力蓝藻代谢工程:从 CO2光合合成透明质酸的创新突破

【字体: 时间:2025年03月28日 来源:Journal of Biological Engineering 5.7

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  透明质酸(HA)在多领域应用广泛,传统生产方式存在局限。研究人员开展蓝藻代谢工程研究,利用模块化基因表达和 CRISPRi 系统优化代谢途径。结果显示,工程菌株 SeHA226 可高效合成 HA,为大规模光合生产 HA 提供方向。

  在生物医学和化妆品领域,透明质酸(Hyaluronic acid,HA)就像一颗璀璨的 “明星分子”。它是一种由 N - 乙酰葡糖胺(GlcNAc)和葡糖醛酸(GlcA)重复单元组成的线性无分支生物聚合物,凭借独特的保湿、润滑等特性,在药物递送、医美填充、护肤品等方面都占据着重要地位。
早期,HA 主要从动物组织中提取,比如鸡冠、牛眼等,但这种方法产量低、成本高,还存在病原体污染风险。后来,微生物发酵法崭露头角,利用像兽疫链球菌(Streptococcus zooepidemicus)这类天然生产者,或是对大肠杆菌(Escherichia coli)、谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)等进行代谢工程改造来生产 HA。然而,这些生产过程往往依赖糖类等有机碳源,不仅成本不低,还面临着可持续性挑战。与此同时,全球都在积极应对气候变化,将目光投向了利用微生物把二氧化碳(CO2)转化为高附加值产品的方向。在这样的背景下,研究如何让蓝藻(Cyanobacteria)利用 CO2高效合成 HA,就成了科研人员们努力攻克的难题。

韩国成均馆大学(Sungkyunkwan University)的研究人员勇挑重担,开展了相关研究。他们以聚球藻(Synechococcus elongatus)PCC 7942 为研究对象,借助模块化基因表达系统和 CRISPR 干扰(CRISPR interference,CRISPRi)系统,对蓝藻的代谢途径进行优化。研究成果发表在《Journal of Biological Engineering》上,为光合驱动的生物聚合物生产开辟了新道路。

研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。首先是基因工程技术,将来源于不同物种的相关基因,如来自兽疫链球菌的 hasA、化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)的 hasB 和 hasC ,以及大肠杆菌的 glmU、glmM 和 glmS 进行密码子优化后,构建到质粒载体中,并整合到蓝藻基因组的中性位点。其次是 CRISPRi 技术,设计针对特定基因的 crRNA,与 dCas12a 结合形成复合物,抑制目标基因表达,调控代谢通量。此外,还使用了定量检测和分子重量分析技术,通过 HA 分析试剂盒检测 HA 产量,利用凝胶过滤色谱 - 折射率检测器(GPC - RI)测定 HA 分子重量。

设计模块化途径实现 HA 光合生产


聚球藻 PCC 7942 自身缺乏催化 HA 合成的透明质酸合酶(hyaluronan synthase,HAS),无法合成 HA。研究人员将 HA 生物合成途径模块化,分为 HA - GlcA 模块和 GlcNAc 模块。通过在蓝藻基因组中性位点 I(NSI)整合编码关键酶的基因,构建了表达不同模块组合的工程菌株,如 SeHA100、SeHA200、SeHA210 和 SeHA220。实验结果显示,只表达 HasA 的 SeHA100 无法检测到 HA 生产;引入 HA - GlcA 模块的 SeHA200 能产生少量 HA;而整合 GlcNAc 模块,尤其是共表达 glmS 基因的 SeHA220,HA 产量显著提升,达到 2.2 ± 0.85 mg/L,相比 SeHA200 增长了 27.5 倍 ,这表明优化 UDP - GlcNAc1P 和 UDP - GlcA 底物池对提高 HA 产量至关重要。

利用 CRISPR - dCas12a 提升光合 HA 产量


为进一步提高 HA 产量,研究人员借助 CRISPR - dCas12a 系统,靶向 F6P 和 G6P 代谢节点,抑制 zwf 和 pfk 基因表达,减少碳流向其他代谢途径,增加 HA 合成前体。实验以 SeHA210 和 SeHA220 为宿主菌株,构建了一系列基因抑制菌株。结果发现,抑制 zwf 或 pfk 基因的菌株,如 SeHA214、SeHA215、SeHA224 和 SeHA225,HA 产量均有显著提高。其中,双抑制 zwf 和 pfk 基因的 SeHA226 表现最为突出,在 15 天时 HA 产量达到 5.0 ± 0.3 mg/L ,比 SeHA220 有明显提升。

工程蓝藻光合 HA 的分子量分析


研究人员对产量最高的 SeHA226 菌株所产光合 HA 进行分子量分析。通过凝胶过滤色谱技术,测定其重均分子量(Mw)为 4.2 MDa,数均分子量(Mn)为 0.8 MDa 。与其他工程菌株相比,该菌株合成的 HA 分子量与天然生产者相当,这说明前体平衡和生长条件对 HA 分子量影响重大。

研究结论表明,利用异源模块化基因表达系统和 CRISPRi 基因抑制系统对蓝藻进行代谢工程改造,能够实现从 CO2高效合成 HA。菌株 SeHA226 在 15 天内从 CO2直接合成了 5.0 ± 0.3 mg/L 的 HA,且分子量达到 4.2 MDa。优化异源代谢途径是实现高分子量光合 HA 生产的关键。这项研究为大规模光合生产 HA 提供了理论和技术基础,尽管目前在扩大生产规模方面还面临一些挑战,如 CO2供应成本、宿主对烟道气中有毒物质的耐受性等,但研究成果仍为未来可持续生物制造 HA 指明了方向,有望推动相关产业的绿色发展。
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