选择性与非选择性培养基对接种弯曲杆菌的禽类冲洗物微生物差异评估:基于16S rRNA测序的生态学解析

《Discover Bacteria》:Assessing microbial differences associated with Campylobacter inoculated poultry rinsates cultured on selective and non-selective plates

【字体: 时间:2025年03月28日 来源:Discover Bacteria

编辑推荐:

  美国研究人员针对禽肉加工中弯曲杆菌检测的培养基选择难题,通过比较Campy-Cefex、mCCDA和TSA三种培养基对C. jejuni、C. coli和C. lari接种样本的培养效果,发现C. jejuni接种组微生物多样性显著高于其他菌种(P<0.05),且TSA培养基显著富集葡萄球菌(Staphylococcus)。该研究为优化食源性病原体检测方案提供了重要生态学依据,发表于《Discover Bacteria》。

  

食源性疾病防控领域,弯曲杆菌(Campylobacter)引发的感染始终是公共卫生的重大挑战。这种仅需800个菌落形成单位(CFU)就能致病的病原体,不仅导致胃肠炎,还可能引发吉兰-巴雷综合征(GBS)等严重并发症。尽管80%的人类感染病例与禽类消费相关,但关于不同弯曲杆菌菌种在禽类加工环境中的生态特性,以及现有检测方法的局限性,仍存在诸多未解之谜。美国威斯康星大学MSABD项目组在《Discover Bacteria》发表的研究,通过创新性地结合微生物组学与培养技术,揭示了培养基选择对弯曲杆菌检测的关键影响。

研究团队采用16S rRNA基因测序技术(V4区),对接种C. jejuni ATCC 700819、C. coli ATCC BAA-1061和C. lari ATCC BAA-1060的商业禽类冲洗物样本进行分析。样本经2×Blood Free Bolton Broth(BFBB)富集后,分别接种于Campy-CefexmCCDATSA三种培养基,在42°C微需氧条件下培养48小时。通过QIIME2平台进行生物信息学分析,结合ANCOM和ADONIS等统计方法评估微生物组成差异。

研究结果显示,不同弯曲杆菌菌种塑造了独特的微生物群落结构。C. jejuni接种组的Pielou均匀度指数和Shannon多样性指数显著高于C. coli和C. lari组(P<0.05),其菌落中毛螺菌科(Lachnospiraceae)和颤螺菌科(Oscillospiraceae)的相对丰度显著增加。值得注意的是,C. coli在mCCDA培养基上未能形成可见菌落,仅通过DNA测序被检出,这提示传统培养方法可能存在漏检风险。

培养基类型对微生物回收率的影响尤为显著。非选择性TSA培养基上葡萄球菌(Staphylococcus)占比高达97.5%,而弯曲杆菌仅占5%。相比之下,两种选择性培养基(Campy-Cefex和mCCDA)的弯曲杆菌检出率超过99%,但两者间微生物组成无显著差异(P>0.05)。这一发现证实了选择性培养基在病原体分离中的优势,同时也揭示了背景微生物对检测结果的潜在干扰。

讨论部分指出,C. jejuni表现出的更高微生物多样性可能与其在禽类肠道中的生态位适应性相关。该菌种可能通过与毛螺菌科等土著菌群的交叉喂养(cross-feeding)关系获得生存优势。研究还强调,现行检测标准主要针对C. jejuni的设计,可能无法有效捕获C. coli和C. lari的污染情况,这为优化禽类加工过程中的微生物监测方案提供了重要依据。

该研究的创新价值在于首次系统评估了培养基选择对不同弯曲杆菌菌种检测的影响机制,为食品工业病原体监测提供了微生物生态学视角。未来研究可进一步探索化学干预措施对弯曲杆菌-共生菌群互作关系的影响,以及开发更精准的分子检测技术以弥补传统培养法的局限性。这些发现对降低食源性疾病风险、完善食品安全监管体系具有重要实践意义。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
    生物通微信公众号
    微信
    新浪微博

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号