发现新菌！云南重楼根内生菌 Taklimakanibacter albus sp. nov. 的多相分类学研究及其意义

《Current Microbiology》：Taklimakanibacter albus sp. nov., an Endophytic Bacterial Species Isolated from the Root of Paris polyphylla var. yunnanensis

来自中国的研究人员为明确从云南重楼根部分离出的菌株 YIM B02566T的分类地位，开展多相分类学研究。结果显示该菌株为新物种 Taklimakanibacter albus，丰富了微生物分类学知识。

　　从中国云南重楼（Paris polyphylla var. yunnanensis）的根中分离出一株革兰氏阴性、白色色素、杆状的细菌菌株 YIM B02566^T。菌株 YIM B02566^T在不添加 NaCl 的 Reasoner’s 2A 琼脂培养基上，28°C、pH 7.0 条件下生长最佳。基于 16S rRNA 基因序列和 433 个单拷贝直系同源基因串联的系统发育分析表明，菌株 YIM B02566^T在 Taklimakanibacter 属中形成一个独特的谱系。YIM B02566^T与 Taklimakanibacter 属的两个已知物种的 16S rRNA 基因序列相似性分别为 99.12%（T. deserti SYSU D60010^T）和 99.05%（T. lacteus SYSU D60012^T）。主要脂肪酸为 C_19:0 cyclo ω8^c、C_16:0和总和特征 8。菌株 YIM B02566^T含有泛醌 - 10（UQ-10）作为唯一的呼吸醌。该菌株的极性脂质包括二磷脂酰甘油、磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰胆碱、一种未鉴定的磷脂、两种未鉴定的氨基脂质和一种未鉴定的极性脂质。全基因组分析表明，基因组大小为 7.2 Mbp，基因组 DNA 的 G + C 含量为 62.9%。菌株 YIM B02566^T与两个 Taklimakanibacter 物种的数字 DNA-DNA 杂交值分别为 24.50%（T. deserti SYSU D60010^T）和 25.40%（T. lacteus SYSU D60012^T）。同时，菌株 YIM B02566^T与其近缘种之间的平均核苷酸一致性（ANI）和平均氨基酸一致性（AAI）值远低于物种确定的建议阈值。因此，基于多相分析，该分离株代表一个新物种，命名为 Taklimakanibacter albus。模式菌株为 YIM B02566^T（= CGMCC 1.18656^T = JCM 34643^T）。