NIPAL4:透明细胞肾细胞癌预后与免疫治疗的关键标志物

《Scientific Reports》:NIPAL4 is an important marker for clear cell renal cell carcinoma prognosis and immunotherapy

【字体: 时间:2025年03月27日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为解决透明细胞肾细胞癌(ccRCC)预后判断困难及治疗靶点缺乏的问题,研究人员开展了关于镁转运蛋白 NIPAL4 在 ccRCC 中作用的研究。结果表明,NIPAL4 高表达与不良预后相关,且可影响肿瘤增殖、迁移,还与免疫细胞浸润有关。这为 ccRCC 治疗提供新方向。

  在癌症的医学研究领域,透明细胞肾细胞癌(ccRCC)一直是个令人头疼的 “难题”。它有着较高的转移率,很多患者在初次诊断时,癌细胞就已经悄悄扩散到身体其他部位;同时,它还对传统的化疗和放疗有很强的抵抗力,常规治疗手段难以取得理想效果。这使得寻找新的、有效的预后标志物和治疗靶点,成为医学研究人员亟待攻克的任务。
在这样的背景下,湖北医药学院人民医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、眉山市第二人民医院、福建医科大学附属第二医院等多家机构的研究人员联合开展了一项关于镁转运蛋白 NIPAL4(NIPA 样结构域包含 4)在 ccRCC 中作用的研究。这项研究成果发表在《Scientific Reports》上,为 ccRCC 的治疗带来了新的希望。

研究人员为了深入探究 NIPAL4 在 ccRCC 中的作用,采用了多种关键技术方法。他们从癌症基因组图谱(TCGA)等数据库获取 ccRCC 患者的 RNA 测序数据和临床信息,运用 R 软件进行数据处理和分析;通过构建预后列线图(Nomogram)、进行生存分析(如 Kaplan-Meier 分析、Cox 回归分析)来评估 NIPAL4 的预后价值;还利用细胞实验(如细胞培养、Western blot 分析、细胞增殖和迁移实验)和动物实验(裸鼠成瘤实验)对 NIPAL4 的功能进行验证。

研究结果如下:

  • NIPAL4 mRNA 表达水平与患者总生存期的关系:研究发现,NIPAL4 在多种肿瘤中高表达,在 ccRCC 中,其 mRNA 在肿瘤组织中的表达显著高于正常组织。通过构建受试者工作特征曲线(ROC),证实 NIPAL4 的表达水平能有效区分 ccRCC 组织和正常组织。生存分析显示,高 NIPAL4 表达组患者的总生存期(OS)明显较差,这表明 NIPAL4 可能是一个癌基因,与 ccRCC 患者的预后密切相关。
  • NIPAL4 表达与临床病理变量和总生存期的相关性:通过独立样本 t 检验、单因素和多因素 Cox 回归分析,发现 NIPAL4 表达与 TNM 分期、性别、临床病理分期、组织学分级等临床参数显著相关。较高的 NIPAL4 表达、病理 M 分期和年龄与 ccRCC 患者较差的总生存期相关,这进一步说明 NIPAL4 可作为 ccRCC 重要的预后生物标志物。
  • NIPAL4 的功能验证:选择 786O 肾 ccRCC 细胞进行功能验证实验。结果显示,NIPAL4 在 786O 细胞中的表达高于正常肾细胞系 HK2。利用 siRNA 沉默 786O 细胞中 NIPAL4 的表达后,细胞的迁移和增殖能力均受到显著抑制,在裸鼠体内,沉默 NIPAL4 的 786O 细胞形成的肿瘤生长也明显受到抑制,这表明 NIPAL4 是肾透明细胞癌细胞增殖和迁移的关键调节因子,有望成为治疗靶点。
  • 预后列线图的开发:构建了包含临床病理变量和 NIPAL4 表达的预后列线图,通过 ROC 分析验证了其预测 ccRCC 患者 OS 的价值,1 年、3 年和 5 年生存率的曲线下面积(AUC)分别为 0.671、0.643 和 0.652 ,校准曲线也证实了该列线图在不同时间间隔预测生存率的准确性,说明结合 NIPAL4 和其他参数可作为预测 ccRCC 患者 OS 的指标。
  • NIPAL4 相关信号通路的鉴定:通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA),发现 NIPAL4 与细胞外基质组织、脂质代谢、TGF-β 信号通路等密切相关,这有助于解释 NIPAL4 影响肿瘤发展和患者预后的机制。
  • NIPAL4 与蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)、肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)的关联:PPI 网络显示 NIPAL4 与多个基因显著相关。在多种肿瘤中,NIPAL4 与 TMB 和 MSI 水平呈负相关,但在 ccRCC 中无显著关联。
  • NIPAL4 与免疫浸润、肿瘤微环境和免疫检查点分子的关联:在 ccRCC 中,NIPAL4 与肿瘤纯度呈强负相关,与多种免疫细胞(如 CD4+ T 细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)的浸润呈正相关,还与多种免疫检查点分子(如 IL10、CD274(PD-L1)、CTLA4、TIGIT 和 ADORA2A)显著相关,提示高 NIPAL4 表达的患者可能对免疫检查点抑制剂治疗有更好的反应。

综上所述,该研究表明 NIPAL4 在 ccRCC 中不仅是有价值的预后标志物,还是潜在的治疗靶点。通过靶向 NIPAL4,有望开发出更有效的治疗策略,改善 ccRCC 患者的预后。不过,研究也存在一定局限性,如仅依赖公共肿瘤数据库,未深入探究 NIPAL4 影响肿瘤微环境的机制等。未来研究可在这些方面进一步探索,为 ccRCC 的治疗提供更坚实的理论基础和实践指导。

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