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基于生物信息学与机器学习的儿童脓毒性休克诊断标志物CD177/MCEMP1/MMP8/OLAH鉴定及免疫浸润特征研究
《Scientific Reports》:Integrating bioinformatics and machine learning for comprehensive analysis and validation of diagnostic biomarkers and immune cell infiltration characteristics in pediatric septic shock
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年03月27日 来源:Scientific Reports 3.8
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《Scientific Reports》最新研究推荐:山东中医药大学附属医院急诊科吕鹏团队整合GSE8121/GSE13904/GSE26378三个基因表达数据集,运用LASSO和SVM-RFE机器学习算法筛选出CD177、MCEMP1、MMP8和OLAH四个诊断标志物(AUC>0.9),通过CIBERSORT解析免疫细胞浸润特征,为儿童脓毒性休克的早期诊断和免疫调控治疗提供新靶点。
儿童脓毒性休克作为威胁全球儿童健康的危急重症,其院内死亡率高达10.8%,但临床仍缺乏有效的早期诊断标志物。传统"细菌理论"向"宿主理论"的认知转变,使研究者意识到免疫失调在脓毒症进展中的核心作用。山东中医药大学附属医院急诊科吕鹏团队在《Scientific Reports》发表的研究,通过整合多组学数据与人工智能算法,为破解这一临床难题提供了创新解决方案。
研究团队采用三大关键技术路线:1)从GEO数据库获取GSE8121/GSE13904/GSE26378三个儿童外周血转录组数据集(样本量>10/组),经sva包校正批次效应后,用LIMMA包筛选出12个差异表达基因(DEGs);2)结合LASSO回归和SVM-RFE机器学习算法鉴定关键标志物,并通过ROC曲线验证诊断效能;3)应用CIBERSORT算法解析22类免疫细胞浸润特征,建立标志物-免疫细胞相关性网络。
研究结果部分揭示重要发现:
DEGs筛选与功能分析:鉴定出全部上调的12个DEGs,GSEA显示补体凝血级联、FcγR介导的吞噬等通路显著激活(P<0.05)。DO分析关联口腔疾病、冠状动脉疾病等,KEGG提示活性氧代谢、细菌防御反应等生物学过程。
诊断标志物鉴定:机器学习交叉筛选出CD177、MCEMP1、MMP8和OLAH四个标志物,在验证集GSE26378中表达差异极显著(P<0.01),诊断AUC值达0.998-0.966。
免疫浸润特征:脓毒症组静息CD4记忆T细胞、γδT细胞等比例升高,而浆细胞、调节性T细胞(Tregs)、M0巨噬细胞等显著降低(P<0.05)。相关性分析显示CD177/MCEMP1与中性粒细胞呈正相关,与静息树突细胞负相关。
讨论部分指出,该研究首次系统揭示CD177(中性粒细胞表面蛋白)、MCEMP1(肥大细胞表达蛋白)、MMP8(基质金属蛋白酶)和OLAH(羟基酰基谷胱甘肽水解酶)构成的诊断组合,其机制可能通过调控中性粒细胞趋化(CD177)、促炎因子释放(MCEMP1)、白细胞粘附(MMP8)等先天免疫过程,推动脓毒症从促炎状态向免疫抑制转化。研究发现获得性免疫细胞(T/B细胞)比例升高而先天免疫细胞(巨噬细胞/中性粒细胞)降低的现象,为"免疫麻痹"理论提供了新证据。
该研究的临床意义在于:①建立机器学习驱动的多标志物诊断模型,突破单指标诊断瓶颈;②揭示免疫细胞动态失衡特征,为个体化免疫调节治疗提供靶点;③所用生物信息学流程(CIBERSORT+机器学习)为其他危重症研究提供方法论参考。作者坦言样本量限制需扩大验证,但这项跨学科研究无疑为儿童脓毒性休克的精准诊疗开辟了新路径。
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