三维调控枢纽：胶质母细胞瘤致癌程序的关键 “掌控者”

为探究三维（3D）细胞核中增强子 - 启动子通讯失调在致癌程序中的作用，研究人员剖析患者来源的胶质母细胞瘤干细胞的 3D 增强子 - 启动子网络。结果发现 3D 调控枢纽影响基因表达和细胞特性，还与癌症预后相关。该研究为理解癌症发生机制提供重要依据。

　　在三维（3D）细胞核中，增强子与启动子之间通讯的失调，越来越被认为是致癌程序的潜在驱动因素。在此，研究人员对源自患者的胶质母细胞瘤干细胞（glioblastoma stem cells，GSCs）的 3D 增强子 - 启动子网络进行了分析，以识别核心调控节点。研究聚焦于高度连接的 3D 调控枢纽（3D hubs），并证实与这些枢纽相互作用的基因在单细胞水平呈现高表达且协同表达，它们还与区分胶质母细胞瘤（glioblastoma，GBM）和低级别胶质瘤的致癌程序相关。对一个在胶质母细胞瘤中功能未知但反复出现的调控枢纽进行表观遗传沉默，足以使与该枢纽相连的基因表达下调，导致转录状态改变，并降低细胞的克隆形成能力。整合 16 种癌症的数据集后，研究人员识别出 “通用” 和癌症类型特异性的 3D 调控枢纽，这些枢纽富含致癌程序相关基因以及与不良预后相关的因子。基因改变仅能解释调控枢纽高度连接性和活性增加的一小部分原因。总体而言，这项研究有力地支持了 3D 调控枢纽在控制致癌程序和细胞特性方面可能具有的核心作用。