美国田纳西州牛源四细小病毒 1 型（UTPV1 - 1882）基因组测序及其对数据库的重要补充

《Microbiology Resource Announcements 0.7》：Genome sequence of a Tetraparvovirus ungulate 1 strain from a cow in Tennessee, USA

为完善美国相关病毒基因组数据库信息，研究人员从田纳西州患呼吸道疾病的 4 月龄牛中开展四细小病毒 1 型（UTPV1 - 1882）基因组测序研究。结果得到该病毒基因组序列，其长度为 5226 核苷酸，这一成果丰富了现有数据库。

　　四细小病毒（Tetraparvoviruses）属于细小病毒科（Parvoviridae），是一类小型无包膜病毒，其单链 DNA 基因组长度在 4000 到 6000 核苷酸之间。四细小病毒 1 型（Tetraparvovirus ungulate 1，UTPV1），又称牛博卡病毒（bovine hokovirus）和有蹄类四细小病毒 1 型（Ungulate tetraparvovirus 1） 。此前，它已在多个地区的牛群中被发现。2023 年，研究人员从美国田纳西州一头因呼吸道疾病安乐死的 4 月龄牛的肺组织样本入手，经一系列处理，如样本匀浆、核酸提取纯化、双链 DNA 酶（dsDNase）处理等，再利用相关试剂盒进行第二链 cDNA 合成和测序文库制备，最后在 Illumina Miniseq 平台上进行双端 2×150 bp 测序，并借助特定的分析流程和工具进行数据分析。最终得到 UTPV1 - 1882 的基因组序列，长度为 5226 核苷酸，GC 含量为 48.95%，且它与 GenBank 中已知的 UTPV1 毒株序列相似度在 88.6% - 99.8% 之间。该研究使用了匹兹堡超级计算中心的 Bridges - 2 和 Jetstream2 云计算资源，得到了相关机构的支持。