《Scientific Reports》:Enzymatic cleavage of model lignin dimers depends on pH, enzyme, and bond type
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为解决木质素修饰酶(LMEs)在不同键型底物上的活性研究受限,以及缺乏有效分析工具的问题,研究人员开展 LMEs 对不同键型木质素二聚体酶解活性的研究,发现酶类型、pH 和键型影响氧化与底物裂解程度,为生物质转化提供依据。
在地球的生物宝库中,木质纤维素是最为丰富的可再生碳源。然而,在造纸业产生的木质素里,仅有 2% 能够实现商业利用,这就好比捧着金饭碗却吃不饱饭,大量的资源被白白浪费。传统的化学处理方法虽然能对木质素进行解聚,但却存在溶剂难以回收、产品产量低,以及解聚后的木质素难以被工程宿主生物转化利用等问题,就像一道道难以跨越的鸿沟,严重阻碍了木质素的高效利用。
而利用木质素修饰酶(LMEs)进行酶解,被视为一种绿色环保的替代方案。LMEs 家族包含漆酶、多功能过氧化物酶、木质素过氧化物酶和锰过氧化物酶等,它们就像一群训练有素的 “分子剪刀”,能利用自由基化学反应切断木质素中的化学键。不过,这些 “剪刀” 在不同 pH 环境下的活性表现,以及它们对木质素中不同类型化学键的作用机制,还存在许多未解之谜。同时,现有的分析工具也难以满足深入研究 LMEs 与木质素相互作用的需求,这就像蒙着一层雾,让研究人员难以看清真相。
为了揭开这些谜团,来自美国多个科研机构的研究人员组成了一支强大的科研团队,开展了一项极具创新性的研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为我们打开了一扇了解木质素酶解机制的新窗口。
在这项研究中,研究人员采用了多种关键技术方法。其中,纳米结构引发剂质谱(NIMS)技术是核心之一,它就像一个高精度的 “分子探测器”,可以快速、灵敏地检测酶解反应的产物。研究人员还合成了四种带有 NIMS 标签的木质素模型化合物,这些化合物就像特制的 “分子探针”,代表了木质素中的 β -0-4、β-β'、5-5' 和 4-O-5' 键。此外,他们运用了质谱成像(MSI)技术和 OpenMSI 阵列分析工具包(OMAAT),对反应产物进行精确分析,从而全面了解酶解反应的过程和结果。
研究结果主要从以下几个方面展开:
- 酶活性筛选:研究人员让十种不同的酶(包括五种漆酶和五种辣根过氧化物酶)与四种代表不同键型的底物进行反应,并在 pH 值为 3 到 10 的范围内进行测试。结果发现,所有的酶都能切割 β -0-4 和 β-β' 模型底物,但切割 5-5' 和 4-O-5' 底物的酶较少,且切割程度也较低。不同酶的活性 pH 范围存在差异,例如,曲霉菌属漆酶和双孢蘑菇漆酶在较高 pH 范围内切割 β -0-4 和 β-β' 模型底物,而变色栓菌漆酶的活性 pH 范围则较低。辣根过氧化物酶在更广泛的 pH 范围内切割 β-β' 和 β -0-4 键,并且其对 β-β' 底物的修饰和切割在较低 pH 下进行,而对 β -0-4 底物则在较高 pH 下进行。
- β-β' 底物的氧化和键裂解途径:所有测试的酶都能切割 β-β' 底物。研究人员进一步以变色栓菌漆酶为例,在 pH 5 的条件下进行研究,发现酶解过程中会产生一系列中间产物和最终裂解产物。通过质谱分析,他们推测出了 β-β' 底物的氧化和裂解途径,并且发现 pH 值会影响裂解产物的相对分布,碱性条件更有利于水解产物的生成。
- 4-O-5’和 5-5’底物的氧化:大多数酶能够氧化 4-O-5’底物,部分酶能氧化 5-5’底物,但这两种底物的键裂解现象很少发生。研究人员发现,这些底物的氧化产物可能是由于添加了氧分子或发生了其他氧化反应。此外,添加 1 - 羟基苯并三唑作为介质,并没有显著改变 5-5’和 4-O-5’底物的聚合、修饰或裂解程度。
研究结论和讨论部分表明,酶类型、pH 和键型共同决定了氧化与底物裂解的程度。这一发现对于生物质转化为生物燃料和生物产品具有重要意义。在实际应用中,不同的原料和化学预处理方法会导致木质素中不同键型的相对比例发生变化。因此,根据木质素的键型组成选择合适的酶和反应条件,能够更高效地实现木质素的解聚和转化,为生物质能源领域的发展提供了新的思路和理论依据。同时,该研究也为后续深入研究 LMEs 与天然木质素的相互作用奠定了基础,虽然目前研究还存在一些局限性,但为未来的研究指明了方向 。
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