《Nature Medicine》纽约市 2022 年猴痘疫情传播动力学研究：揭示传播规律，助力防控策略制定

《Nature Medicine》：Transmission dynamics of the 2022 mpox epidemic in New York City

　　

猴痘病毒传播动力学研究：纽约市 2022 年疫情的深度剖析

在 2022 年，一场突如其来的全球猴痘（mpox）疫情打破了平静。这场疫情由猴痘病毒（MPXV）IIb 分支 B.1 谱系引发，主要通过性接触网络传播，给全球公共卫生带来了巨大挑战。纽约市（NYC）成为美国首个且疫情规模最大的地区，面对这一严峻形势，深入了解 MPXV 在纽约市的传播动力学变得至关重要。此前，虽然有研究对其他性传播病原体的传播网络有所了解，但对于 MPXV 在纽约市的传播情况，仍存在诸多未知。比如，MPXV 是如何传入纽约市的？其传播过程有何特点？与其他性传播疾病（如 HIV）的传播网络又有怎样的关联？这些问题都亟待解决，因为只有弄清楚这些，才能制定出更有效的防控策略，保障公众健康。

来自多个研究机构的研究人员共同开展了这项研究，其中第一作者 Jonathan E. Pekar 来自英国爱丁堡大学（University of Edinburgh）等机构 。研究成果发表在《Nature Medicine》杂志上，为我们深入理解猴痘病毒传播提供了关键线索。

研究人员运用了多种关键技术方法。在基因组分析方面，他们收集了 2022 年 4 月至 2023 年 4 月纽约市 757 例、美国其他地区 1127 例以及全球其他地区 2160 例的 MPXV 基因组数据，并进行了系统的处理和分析。通过构建系统发育树，对病毒的进化关系和传播路径进行推断。在流行病学分析上，利用病例数据和疫苗接种数据，结合不同模型，如 EpiNow2 和基于基因组的方法，来推断有效再生数（Re?）和疫情的增长速率，以此评估疫情的发展趋势。此外，还基于男男性行为者（MSM）的性接触网络进行了疫情模拟，探究传播机制。

下面来看具体的研究结果：

1. 猴痘在纽约市的出现：纽约市猴痘疫情在 2022 年夏季迅速增长，病例数在 7 月下旬达到峰值，早于美国其他地区和全球。纽约市对猴痘感染病例的测序比例较高，有助于进行精细的系统发育地理分析。研究推断，MPXV 可能在纽约市和美国其他地区隐匿传播了 1 - 2 个月，全球 MPXV 传入纽约市始于 4 月，6 月中旬达到高峰，且纽约市向美国其他地区有较多的病毒输出。

2. MPXV 传播簇：研究人员识别出 84 个纽约市 MPXV 传播簇，多数传播簇可通过至少一个突变可靠识别。通过分析，发现黑人或非裔美国人个体加入 MPXV 传播簇的几率增加，而白人个体和近期有国外旅行史的个体几率降低。传播簇成员身份与性别、性取向、年龄或疫苗接种状态无显著关联。

3. MPXV 与 HIV 传播簇的关联：MPXV 和 HIV 传播簇大小分布均高度右偏，且均符合无标度分布，表明二者传播动力学可能相似。研究还发现，感染 MPXV 的个体中，有相当比例同时感染 HIV，且 MPXV 感染与 HIV 诊断之间存在显著关联，同时感染两种病毒的个体多属于更紧密连接的性网络。

4. 纽约市猴痘疫情的下降：通过多种方法推断有效再生数（Re?）和增长速率，发现疫情在 7 月底达到高峰时，Re?在 6 月下旬达到峰值后开始下降，在疫苗接种剂量较少时，Re?就已降至 1 以下，这表明疫苗接种对疫情下降的影响有限。

5. 重尾性接触网络驱动疫情动态：基于 MSM 性接触网络的模拟显示，重尾性接触网络可解释疫情在产生实质性免疫之前的下降。高度连接的个体在疫情早期易感染，其感染导致性网络中密集连接部分的早期饱和，进而促使疫情以较低的累积发病率结束。

研究结论和讨论部分指出，纽约市长期的分子监测为研究 MPXV 和 HIV 传播网络之间的关联提供了契机。研究发现，早期引入纽约市的 MPXV 导致的传播簇更大，通过重尾性接触网络传播可以解释纽约市的疫情趋势。MPXV 和 HIV 虽然都通过重尾性接触网络传播，但由于自然史和进化史的差异，传播网络有所不同。尽管疫苗接种对 2022 年纽约市猴痘疫情的遏制作用有限，但可能在预防社区传播反弹方面起到了一定作用。

这项研究的意义重大，它为我们深入理解猴痘病毒在纽约市的传播机制提供了关键信息，有助于公共卫生部门制定更具针对性的防控策略。同时，研究结果也为未来研究性传播病原体的传播动力学提供了重要参考，推动了相关领域的进一步发展。