低温培养抑制鱼类 CRISPR-Cas9 脱靶突变:解锁基因研究精准新路径
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时间:2025年03月26日
来源:Transgenic Research 2.7
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为解决 CRISPR-Cas9 脱靶突变问题,研究人员开展鱼类低温培养研究,发现可降低脱靶率,获可靠数据。
在鱼类基因功能研究中,CRISPR-Cas9 基因敲除(Gene knockout)技术被广泛应用。然而,CRISPR-Cas9 有时会引发意外的基因改变,即脱靶突变(off-target mutations),这会影响表型分析(phenotypic analysis)数据的可靠性。本研究聚焦于对诱变有显著影响的培养温度,探究在青鳉(medaka)和斑马鱼(zebrafish)早期胚胎中导入 CRISPR-Cas9 后进行低温培养,是否能抑制脱靶突变。持续在 16°C 培养青鳉,相比 28°C,脱靶突变率显著降低,但青鳉胚胎存活率下降。因此,对青鳉和斑马鱼均只在早期发育阶段进行低温培养,之后升温至 28°C。在此条件下,青鳉三个脱靶区域(Off-D、Off-P 和 Off-A)的突变率显著下降,而三个靶标区域(DJ-1、p4hb和avt)的突变率不受影响。同样,斑马鱼靶标区域(ywhaqa)的突变率依旧很高,但其脱靶区域(Off-Y1)的突变率显著降低。此外,该方法有效抑制了青鳉脱靶突变的种系传递(germ line transmission)。这一方法有助于从青鳉和斑马鱼的 G0代获取更可靠的数据,还可能减少在 F1代筛选去除携带脱靶突变个体的工作量。
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