精准定位 msk基因候选区域,加速辣椒杂交育种进程
《Horticulture, Environment, and Biotechnology》:Development of a molecular marker based on the candidate gene CaMYB80 for genic male sterility msk in pepper (Capsicum annuum L.)
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时间:2025年03月26日
来源:Horticulture, Environment, and Biotechnology 2.5
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为定位 msk基因,研究人员开发 HRM 标记构建精细图谱,确定候选基因,助力辣椒育种。
辣椒(Capsicum annuum L.)杂交品种常利用细胞质雄性不育(CGMS)或基因雄性不育(GMS)系统进行经济高效的种子生产。目前已报道超 20 个辣椒 GMS 基因,自然发生的 msk在韩国辣椒育种中应用广泛。本研究旨在通过开发高分辨率熔解(HRM)标记构建 msk基因座附近的精细图谱,并鉴定 msk基因的候选基因。研究利用 806 株 F2植株进行标记开发和精细图谱构建,从雄性可育(MskMsk)和雄性不育(mskmsk)植株的下一代重测序中识别单核苷酸多态性(SNP),开发出 14 个 HRM 标记并构建精细图谱。将遗传连锁图谱与辣椒 10 号参考染色体的物理图谱对比,发现图谱标记顺序同线性。5 个 HRM 标记 HRM1524718、HRM1530835、HRM1531314、HRM1534857 和 HRM1535009 与雄性育性表型共分离,将目标区域限定在 10 号染色体上 142 kb(693 - 835 kb)范围内,在此区域鉴定出 12 个候选基因。其中强候选基因 T459_24638(CaMYB80)编码转录因子 MYB80,已有研究表明该因子在拟南芥(Arabidopsis thaliana)花粉发育和绒毡层程序性细胞死亡调控中发挥关键作用。对比雄性可育(MskMsk)和雄性不育(mskmsk)植株的 T459_24638 基因序列,发现 msk等位基因的第三外显子存在 163 bp 插入,导致提前终止密码子出现,这意味着该基因的破坏可能引发雄性不育。基于此插入,开发出 msk - HRM 标记用于区分 Msk和 msk等位基因。这些研究结果表明,基于基因的标记有望加速利用 GMS 的辣椒杂交育种进程,同时对候选基因的鉴定也有助于深入理解辣椒花粉发育的分子机制。
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