阿根廷 O22:H8大肠杆菌基因组探秘：肠道定植优势基因的发现之旅

《Current Microbiology》：Whole-Genome Sequence Reveals Genetic Determinants of the Colonization of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli O22:H8 Isolates in Cattle

为探究牛源 O22:H8与 O157:H7 STEC 菌株遗传差异，研究人员开展研究，发现 O22:H8优势基因，助力防控。

　　产志贺毒素大肠杆菌（Shiga toxin-producing Escherichia coli，STEC）是一种人畜共患的食源性病原体，在全球范围内引发人类严重肠道疾病的病例和疫情。研究团队之前发现，阿根廷 O₂₂:H₈分离株（155 和 182）在实验性牛感染模型中会干扰 O₁₅₇:H₇的定植。在本研究中，研究人员运用比较基因组和全基因组关联研究（GWAS）分析，探索牛源 O₂₂:H₈和 O₁₅₇:H₇菌株遗传基础的差异。将 O₂₂:H₈ 155 和 182 分离株的全基因组序列，与 33 株牛源 O₂₂:H₈和 156 株牛源 O₁₅₇:H₇分离株进行对比。结果显示，O₂₂:H₈分离株携带与植物源产物代谢相关的特定代谢途径基因，而 O₁₅₇:H₇分离株中没有这些基因。这些 O₂₂:H₈分离株还携带与非 O₁₅₇分离株黏附相关的黏附与自聚集位点的经典基因。此外，研究发现，在阿根廷 O₂₂:H₈分离株中预测到的与细菌竞争相关的 T6SS-1 簇，在 O₁₅₇:H₇和其他 O₂₂:H₈分离株中均不存在。研究首次预测了 VI 型分泌系统 1 位点（LT6SS-T1），这是一个包含 T6SS-1 簇基因和与 STEC 发病机制相关基因的基因组岛。该研究揭示了阿根廷 O₂₂:H₈分离株中的一组基因，这些基因可能在牛肠道定植过程中赋予其相对于 O₁₅₇:H₇的优势。