编辑推荐:
为探究细菌 Zorya 抗噬菌体系统机制,研究人员结合多种技术,揭示其结构功能,为生物技术研究提供新思路。
细菌 “高科技” 防御机制的探索之旅:Zorya 系统研究解读
在微观的生命世界里,细菌与噬菌体之间无时无刻不在上演着一场激烈的 “战争”。长久以来,人们都知道人类拥有一套精妙复杂的免疫系统,能抵御外界病原体的侵袭。但随着 CRISPR-Cas(规律成簇间隔短回文重复序列及其相关蛋白系统,是细菌的一种适应性免疫系统)的发现,科学界才惊觉,细菌也有着自己独特的防御手段,它们能巧妙应对噬菌体 —— 这类专门感染并摧毁细菌的病毒。
近年来,随着生物信息分析技术的飞速发展,越来越多细菌的免疫系统被挖掘出来,其中就包括 2018 年以色列魏茨曼科学研究所罗泰姆?索雷克斯(Rotem Soreks)研究小组发现的 Zorya 系统,这个名字源于斯拉夫神话中的女神。尽管 Zorya 系统被发现,但在此之前,它精确的分子运作方式却如同蒙上了一层神秘的面纱,鲜为人知。这一知识空白不仅限制了人们对细菌免疫机制的深入理解,也阻碍了相关生物技术的进一步发展。比如在合成生物学领域,由于不清楚 Zorya 系统的详细机制,难以将其应用于设计更高效的生物工程菌;在对抗细菌感染方面,也无法利用该系统开发创新的治疗策略。为了填补这一空白,解开 Zorya 系统的奥秘,国际研究团队展开了深入研究,其成果发表在《BIOspektrum》上。
研究人员为了探究 Zorya 系统的分子机制,采用了冷冻电镜(Kryo-Elektronenmikroskopie)和荧光显微镜(Fluoreszenzmikroskopie)技术。冷冻电镜能够在接近生理状态下,对生物大分子的结构进行高分辨率解析,帮助研究人员看清 Zorya 系统中蛋白质的精细结构;荧光显微镜则可以实时观察细胞内分子的动态变化,为研究 Zorya 系统在细菌细胞内的运作过程提供了有力支持。研究过程中虽未提及样本队列来源,但凭借这两种关键技术,研究人员得以从分子层面深入剖析 Zorya 系统。
Zorya 系统的结构与激活机制
Zorya 系统的独特之处在于其模块化的蛋白质架构,这一架构使得细菌能够精确识别并降解噬菌体 DNA。研究发现,ZorA、ZorB、ZorC 和 ZorD 这四种核心蛋白在其中发挥着关键作用。ZorA 和 ZorB 形成膜相关复合物 ZorAB,它就像一个由质子驱动的旋转马达,在识别噬菌体感染和信号传导过程中扮演着决定性角色。ZorA 拥有细胞质结构域,ZorB 则具备肽聚糖结合结构域(Peptidoglykan-Bindedom?ne) 。在未被感染的正常状态下,由于细菌内膜与肽聚糖层之间的距离过大,ZorB 无法与细胞壁相互作用。然而,一旦噬菌体入侵细菌,细菌的膜结构就会发生改变,此时 ZorB 能够与肽聚糖层相互作用并被激活。这种激活过程如同按下了启动按钮,精准地招募效应蛋白 ZorC 和 ZorD 到 ZorA 位于细胞质的区域。
噬菌体 DNA 的识别与降解
被招募而来的 ZorC 会特异性地结合噬菌体 DNA,而 ZorD 则凭借核酸酶(Nuklease)活性,对噬菌体 DNA 进行靶向降解。通过这一系列紧密配合的过程,Zorya 系统能够精准地识别并摧毁侵入细菌细胞的噬菌体 DNA,有效阻止噬菌体 DNA 的复制,进而抑制噬菌体的繁殖。
与其他细菌免疫系统的差异
与许多其他细菌免疫系统不同,Zorya 系统展现出了独特的优势。不少已知的细菌免疫系统在应对噬菌体感染时,往往会触发宿主细胞的自我毁灭模式,以此来阻止感染循环。但 Zorya 系统却能在噬菌体 DNA 刚进入细菌细胞时,就对其进行靶向降解,让细菌在抵御噬菌体攻击的同时,还能保持存活并正常发挥功能。这一特性使得 Zorya 系统在众多细菌免疫系统中脱颖而出。
此次研究成功揭示了 Zorya 抗噬菌体系统的详细分子机制,让人们首次得以深入了解其结构和功能。这一成果意义重大,为生物技术研究开辟了新的视角。从长远来看,它有望推动合成生物学领域的创新发展,例如利用 Zorya 系统设计更具抗性的工程菌;同时,也为对抗细菌感染提供了全新的思路,或许未来能基于此开发出更有效的抗菌策略。不过,目前的研究只是初步探索,未来还需要进一步深入研究 Zorya 系统在不同环境下的功能,以及如何将其更好地应用于实际。但无论如何,这项研究都为生命科学和健康医学领域的发展奠定了重要基础,让人们对细菌世界的防御机制有了更为深刻的认识。
濠电偞鍨堕幐鎼侇敄閸緷褰掑炊閳规儳浜鹃柣鐔煎亰濡插湱鈧鎸哥€涒晝鈧潧銈搁弫鍌炴倷椤掍焦鐦庨梺璇插缁嬫帡宕濋幒妤€绀夐柣鏃傚帶杩濇繝鐢靛Т濞茬娀宕戦幘鎰佹僵鐎规洖娲ㄩ悾铏圭磽閸屾瑧顦︽俊顐g矒瀹曟洟顢旈崨顖f祫闂佹寧绻傞悧鎾澄熺€n喗鐓欐繛鑼额嚙楠炴﹢鏌曢崶銊ュ摵鐎殿噮鍓熼獮宥夘敊閻e本娈搁梻浣藉亹閻℃棃宕归搹顐f珷闁秆勵殕椤ュ牓鏌涢幘鑼槮濞寸媭鍨堕弻鏇㈠幢濡ゅ﹤鍓遍柣銏╁灡婢瑰棗危閹版澘顫呴柣娆屽亾婵炲眰鍊曢湁闁挎繂妫欑粈瀣煃瑜滈崜姘┍閾忚宕查柛鎰ㄦ櫇椤╃兘鏌ㄥ┑鍡欏ⅵ婵☆垰顑夐弻娑㈠箳閹寸儐妫¢梺璇叉唉婵倗绮氶柆宥呯妞ゆ挾濮烽鎺楁⒑鐠団€虫灁闁告柨楠搁埢鎾诲箣閿旇棄娈ュ銈嗙墬缁矂鍩涢弽顓熺厱婵炲棙鍔曢悘鈺傤殽閻愬弶鍠橀柟顖氱Ч瀵噣宕掑Δ浣规珒
10x Genomics闂備礁鎼崐鐟邦熆濮椻偓楠炴牠鈥斿〒濯爄um HD 闁诲孩顔栭崰鎺楀磻閹剧粯鐓曟慨妯煎帶閻忕姷鈧娲滈崰鎾舵閹烘骞㈡慨姗嗗墮婵啴姊洪崨濠傜瑨婵☆偅绮嶉妵鏃堝箹娴g懓浠㈤梺鎼炲劗閺呮粓鎮鹃柆宥嗙厱闊洤顑呮慨鈧┑鐐存綑濡粓濡甸幇鏉垮嵆闁绘ḿ鏁搁悡浣虹磽娴e憡婀版俊鐐舵铻為柛褎顨呯粈鍡涙煕閳╁啞缂氶柍褜鍏涚划娆撳极瀹ュ鏅搁柨鐕傛嫹
婵犵數鍋涘Λ搴ㄥ垂閼测晜宕查悗锝庡亞閳绘棃鎮楅敐搴″箺缂佷胶娅墂ist闂備線娼уΛ妤呮晝閿濆洨绠斿鑸靛姇濡ɑ銇勯幘璺轰粶缂傚秳绶氶弻娑㈠冀閵娧冣拡濠电偛鐗婇崢顥窱SPR缂傚倷鐒︾粙鎺楁儎椤栫偛鐒垫い鎺嗗亾妞わ缚鍗抽幃褔宕妷銈嗗媰闂侀€炲苯澧村┑鈥愁嚟閳ь剨缍嗛崜姘跺汲閳哄懏鍊垫繛鎴炵懃婵啴鏌涢弮鎾村
闂備礁鎲¢〃鍡椕哄⿰鍛灊闊洦绋掗崵鍕煟閹邦剦鍤熼柕鍫熸尦楠炴牠寮堕幋鐘殿唶闂佸憡鐟ュΛ婵嗩潖婵犳艾惟闁靛绲煎ù鐑芥煟閻樿京鍔嶇憸鏉垮暣閹儵鏁撻敓锟� - 婵犵數鍎戠徊钘夌暦椤掑嫬鐭楅柛鈩冡缚椤╂煡鏌涢埄鍐惧毀闁圭儤鎸鹃々鐑藉箹鏉堝墽绉甸柛搴㈠灥閳藉骞橀姘濠电偞鍨堕幖鈺傜濠婂啰鏆﹂柣鏃囨绾惧ジ鏌涢埄鍐闁告梹甯¢幃妤呭捶椤撶偘妲愰梺缁樼⊕閻熝囧箯鐎n喖绠查柟浼存涧閹線姊洪崨濠傜濠⒀勵殜瀵娊鎮㈤悡搴n唹濡炪倖鏌ㄩ悘婵堢玻濞戙垺鐓欓悹銊ヮ槸閸婂鎮烽姀銈嗙厱婵炲棙锚閻忋儲銇勯銏╁剶鐎规洜濞€瀵粙顢栭锝呮诞鐎殿喗鎮傞弫鎾绘晸閿燂拷
濠电偞鍨堕幐鎼侇敄閸緷褰掑炊椤掆偓杩濇繝鐢靛Т鐎氼噣鎯屾惔銊︾厾鐎规洖娲ゆ禒婊堟煕閻愬瓨灏﹂柟钘夊€婚埀顒婄秵閸撴岸顢旈妶澶嬪仯闁规壋鏅涙俊铏圭磼閵娧冾暭闁瑰嘲鎳庨オ浼村礃閵娧€鍋撴繝姘厸閻庯綆鍋勬慨鍫ユ煛瀹€鈧崰搴ㄥ煝閺冨牆鍗抽柣妯挎珪濮e嫰鏌f惔銏⑩姇闁告梹甯″畷婵嬫偄閻撳宫銉╂煥閻曞倹瀚�