合成微生物学开辟新路径:固定 CO2的创新代谢通路

《BIOspektrum》:Synthetische Mikrobiologie – ein neuer CO2-fixierender Stoffwechselweg

【字体: 时间:2025年03月26日 来源:BIOspektrum

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  为解决 CO2固定代谢通路的问题,Tobias Erb 团队研究 LCM 模块,发现新通路,具生物技术应用潜力。

  

合成微生物学新突破:创新 CO2固定代谢通路

在当今时代,可持续生物技术的发展至关重要,而高效固定二氧化碳(CO2)的合成代谢通路更是其中的关键一环。过往研究中,虽然已经开发出多种 CO2固定的代谢通路,但它们或多或少存在一些问题。许多自然和合成的 CO2固定代谢通路都会生成乙酰辅酶 A(Acetyl-CoA)这一关键中间产物。自然情况下,为了将 Acetyl-CoA 转化为其他细胞组成部分,会采用像乙醛酸循环这样的方式,但往往会产生 C4 化合物,比如草酰乙酸。若要进一步合成丙酮酸(Pyruvate)这种 C3 中间产物,草酰乙酸需要脱羧,这就导致之前固定的碳元素流失。另外,一些还原性的 CO2同化途径,要么需要还原当量,要么包含对氧气敏感的酶,就像产乙酸细菌的 Wood-Ljungdahl 途径,这极大地限制了这些通路在实际中的应用。
为了解决这些问题,来自国外的 Tobias Erb 团队开展了深入研究。他们致力于探索新的 CO2固定代谢通路,最终发现了 LCM 模块(Lactyl-CoA-Mutase 模块),这一成果发表在《BIOspektrum》上。这一发现意义重大,为可持续生物技术的发展提供了新的方向,有望推动生物技术领域的重大变革。
在这项研究中,研究人员用到的主要关键技术方法有:通过酶工程(Enzyme-Engineering)创造出自然界不存在的乳酸辅酶 A 变位酶(Lcm);利用生长耦合选择和 eMutaT7 系统进行超突变(Hypermutation),将自然存在的依赖 B12的 2 - 羟基异丁酰辅酶 A 变位酶转化为 Lcm。
研究结果如下:
  1. LCM 模块代谢通路解析:LCM 模块是一种全新的合成代谢通路,能够在有氧条件下将 Acetyl-CoA 转化为 Pyruvate 以及其他 C3 中间产物。该模块由六个反应组成,先是将 Acetyl-CoA 羧化并转化为 C3 化合物 3 - 羟基丙酰辅酶 A,接着在 Lcm 的催化下转化为乳酸辅酶 A(Lactyl-CoA)。这一核心步骤在整个反应级联中起到限速作用。研究团队还在体外验证了从 Acetyl-CoA 到 Lactyl-CoA 的整个反应级联的功能性。
  2. 关键酶的改造与优化:研究的核心是将自然存在的依赖 B12的 2 - 羟基异丁酰辅酶 A 变位酶改造为 Lcm。通过生长耦合选择和 eMutaT7 系统超突变相结合的方法,新反应的活性(kcat/Km)已经提高了 10 倍,但对于生物技术应用来说,活性还需再提高两个数量级。
研究结论和讨论部分指出,LCM 模块作为一种全新的、可在有氧条件下固定 CO2的代谢通路,为合成生物学和生物技术领域带来了新的希望。虽然目前关键酶的活性还需要进一步提升,但一旦达到生物技术应用的要求,就可以有多种具有巨大经济潜力的应用。例如,可用于发酵生产 3 - 羟基丙酸,它是丙烯酸的潜在前体;还能将 CO2作为原料应用于生物技术生产过程中。这不仅有助于缓解温室气体排放问题,还能为生物产业提供新的原料来源,推动可持续生物技术的发展,在未来的生物制造、环境保护等领域具有不可估量的价值,为相关领域的研究和发展开辟了新的道路。
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