长期地下生活的盲鼹鼠 DNA 结构藏着长寿秘密?研究揭示其与寿命的关联

《Biogerontology》:Structural features of DNA and their potential contribution to blind mole rat (Nannospalax xanthodon) longevity

【字体: 时间:2025年03月26日 来源:Biogerontology 4.4

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  为探究 DNA 结构与寿命的关系,研究人员对比长寿命盲鼹鼠(Nannospalax xanthodon)和短寿命大鼠(Rattus rattus)的 DNA,发现盲鼹鼠 A、Z 型 DNA 比例更高,或与长寿有关,为衰老研究提供新视角。

  在生命科学的研究领域中,衰老一直是备受关注的热门话题。长久以来,人们不断探索着衰老的奥秘,试图解开生物体寿命长短的谜团。以往对 DNA 的研究,大多聚焦于其携带的遗传密码,然而近年来,科学家们逐渐意识到,DNA 的结构变化在癌症、遗传疾病以及基因调控等方面发挥着极为关键的作用。像从 B 型 DNA 转变为 A 型或 Z 型 DNA 这样的结构改变,会影响 DNA 的稳定性和灵活性,而这又受到 DNA 甲基化、糖构象变化等因素的影响。但目前,关于 DNA 结构与生物体寿命之间的直接联系,科学界仍知之甚少。
为了深入探究这一未知领域,来自土耳其比莱吉克谢赫埃迪巴利大学(Bilecik ?eyh Edebali University)的研究人员 Gamzenur S?nmez 和 Tuba Ya?c? Gurbanov 开展了一项极具意义的研究。他们将研究成果发表在《Biogerontology》杂志上。
研究人员采用了傅里叶变换红外光谱(FTIR)技术和主成分分析(PCA)方法 。从存档的肝脏组织标本中提取长寿命的盲鼹鼠(Nannospalax xanthodon)和短寿命的大鼠(Rattus rattus)的基因组 DNA,这些标本来自预先收集且经相关机构批准使用的样本,确保了研究的合法性和样本的健康性。

研究结果

  1. 主成分分析(PCA)结果:对 DNA 样本进行 PCA 分析,在真实指纹光谱区域(1485 - 650 ),PC-1 坐标上盲鼹鼠和大鼠的 DNA 样本明显分离,PC-1 解释了总方差的 74%,表明两者 DNA 结构存在显著差异。在反对称伸缩带区域(1300 - 1200 )进行 PCA,样本沿 PC-1 轴有 90% 的分离,说明 DNA 主链结构的差异是两者的重要区别。
  2. DNA 构象分布差异:对比分析发现,盲鼹鼠中 A 型 DNA 占总 DNA 结构的 29.82%,Z 型占 28.78%;而大鼠中 A 型仅占 14.71%,Z 型占 19.83%,尽管 B 型 DNA 在两种物种中都占主导,但大鼠的 B 型 DNA 比例(65.46%)远高于盲鼹鼠(41.40%) 。此外,盲鼹鼠的 A/B + Z 和 Z/A + B 构象指数显著高于大鼠,ROC 曲线分析显示这些指数能完美区分两种物种。
  3. 糖构象差异:在糖磷酸振动模式方面,与 Z 型 DNA 相关的呋喃糖环 C-O 伸缩振动在盲鼹鼠中强度更高,表明盲鼹鼠 DNA 形成 Z 型结构的倾向更大。同时,盲鼹鼠中与非经典 DNA 螺旋相关的 N 型(C3-endo)糖环构象强度增加,S 型(C2-endo)糖环构象强度降低;大鼠则相反。
  4. 碱基振动差异:对含氮嘌呤和嘧啶碱基的振动模式分析发现,盲鼹鼠在与胞嘧啶相关的振动带(如 1286 - 1285 的 C5 = C6 伸缩振动、1508 和 1524 的平面内胞嘧啶环振动模式)强度显著升高;大鼠在 1517 的胞嘧啶平面内振动带强度增强。此外,盲鼹鼠中腺苷、胸苷的反构象和鸟苷的顺构象相关振动带强度也更高。

研究结论与讨论

该研究揭示了盲鼹鼠和大鼠在 DNA 结构上存在显著差异。盲鼹鼠体内非经典的 A 型和 Z 型 DNA 构象比例更高,同时伴随着糖构象的变化,这些结构特征可能与盲鼹鼠的长寿和对地下环境的适应有关。Z 型 DNA 在转录控制和双链断裂修复中起作用,其在盲鼹鼠中的富集或许有助于维持基因组的稳定性,进而延长寿命。另外,通过对碱基振动模式的研究发现,两种物种在碱基堆积相互作用、氢键动力学等方面存在差异,这也可能影响 DNA 的结构和功能,与它们的寿命差异相关。
这项研究为理解 DNA 结构与寿命之间的关系提供了新的视角,表明 DNA 拓扑结构可能是寿命的生物分子决定因素。不过,目前还无法确定这些结构变化与寿命之间存在直接的因果关系,未来还需要进一步研究,明确这些结构特征如何与表观遗传、蛋白质稳态和代谢网络协同作用,从而调节健康衰老过程。

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