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为探究三阴性乳腺癌(TNBC)机制,研究人员研究 H2AS40的 O-GlcNAcylation 修饰,发现其促进 TNBC 增殖和侵袭,为治疗提供新方向。
攻克三阴性乳腺癌的新征程:H2AS40的 O-GlcNAcylation 修饰研究
在癌症的世界里,乳腺癌是女性健康的一大杀手,而三阴性乳腺癌(TNBC)更是其中的 “狠角色”。TNBC 对内分泌治疗和抗 HER2 靶向治疗都有抵抗,预后差、转移率高,就像一个难以攻克的顽固堡垒,让医生和患者都头疼不已。目前,虽然知道 O-GlcNAc 修饰在癌症进程中发挥着作用,但在 TNBC 中,到底是哪些关键的 O-GlcNAc 修饰蛋白在 “兴风作浪”,还不清楚。此前有研究发现,组蛋白 H2A 的丝氨酸 40 位点会发生 O-GlcNAcylation 修饰(H2AS40Gc),这个位点在 H2A 的球状结构域内,很可能通过改变染色质构象来调控基因表达,成为 TNBC 背后的 “神秘推手”。带着这些疑问,日本冈山理科大学兽医学部遗传学实验室的研究人员 Yoko Uno 和 Koji Hayakawa 开启了探索之旅,相关研究成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员在此次研究中主要运用了以下几种关键技术方法:一是染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq),用于分析 H2AS40Gc 在基因组上的结合位点;二是 RNA 测序(RNA-seq),通过对细胞内 RNA 进行测序,找出受 H2AS40Gc 调控的基因;三是蛋白质印迹法(WB),检测细胞中相关蛋白的表达水平;四是基因本体分析(GO analysis),对差异表达基因进行功能富集分析,探究其参与的生物学过程。研究样本为从美国典型培养物保藏中心(ATCC)购买的多种乳腺癌细胞系,包括管腔型乳腺癌(luminal-type BC)细胞系和 TNBC 细胞系。
接下来看看研究的具体成果:
- TNBC 细胞中 H2AS40Gc 水平较高:研究人员用 WB 检测了三种 luminal-type BC 细胞系和四种 TNBC 细胞系中 H2AS40Gc 的含量,结果令人惊讶,TNBC 细胞中 H2AS40Gc 水平比 luminal-type BC 细胞高约 8 倍。进一步研究发现,这种高水平与 O-GlcNAc 转移酶(OGT)、O-GlcNAcase MEGA5 的表达,以及编码 H2A 的基因表达都没有关系,这表明可能存在其他未知机制在调控 H2AS40Gc 水平。
- H2AS40Gc 促进 TNBC 细胞增殖相关基因的表达:在 TNBC 细胞系 MDA-MB-231 中,研究人员通过敲低(KD)H2AS40相关基因,抑制 H2AS40Gc 的表达。RNA-seq 和基因集富集分析(GSEA)显示,“癌症通路” 相关基因受影响最大。有 17 个属于该通路的基因在 H2AS40-KD 细胞中显著下调,这些基因在 TNBC 细胞中的表达原本就高于 luminal-type BC 细胞,且与乳腺癌生长相关,说明 H2AS40Gc 可通过调控这些基因促进细胞增殖。
- H2AS40Gc 加速 TNBC 细胞的增殖和侵袭:细胞增殖实验表明,H2AS40-KD 的 TNBC 细胞增殖能力下降,过表达 H2AS40可恢复增殖活性,而 H2AS40A 突变体则不行。GO 分析显示,H2AS40-KD 细胞中 “细胞迁移的正调控” 相关基因显著富集。侵袭实验也证实,H2AS40-KD 细胞的侵袭能力降低,过表达 H2AS40可挽救这一现象,再次证明 H2AS40Gc 能促进 TNBC 细胞的增殖和侵袭。
- H2AS40Gc 靶向 KDM5B:ChIP-seq 数据显示,17 个下调基因并非 H2AS40Gc 的直接靶点。通过分析,研究人员发现 H2AS40Gc 与抑制性组蛋白标记 H3K27me3相似,具有抑制基因表达的作用。进一步筛选发现,KDM5B 是 H2AS40Gc 的直接靶基因,它编码 H3K4 的去甲基化酶。在 TNBC 细胞中,H2AS40Gc 在 KDM5B 启动子区域富集,抑制其表达。
- H2AS40Gc 抑制 TNBC 细胞中 KDM5B 的表达:当 H2AS40Gc 在 KDM5B 启动子区域水平降低时,KDM5B 的表达和在 17 个下调基因区域的结合增加。同时敲低 H2AS40和 KDM5B,可恢复 17 个下调基因的表达,以及细胞的增殖和侵袭能力。过表达 KDM5B 则会降低细胞的增殖和侵袭能力,而且 H2AS40-KD 会使 17 个下调基因位点的 H3K4me3水平下降,这表明 H2AS40Gc 通过抑制 KDM5B 的表达,提升 H3K4me3水平,促进相关基因表达,进而影响 TNBC 细胞的增殖和侵袭。
综合来看,研究人员发现 H2AS40Gc 在 TNBC 细胞中高度修饰,它通过富集在 KDM5B 启动子区域,抑制 KDM5B 表达,使 H3K4me3水平升高,从而促进与细胞增殖和迁移相关基因的表达,增强 TNBC 细胞的增殖和侵袭能力。这一发现揭示了 TNBC 发展的新机制,为 TNBC 的治疗提供了潜在的分子靶点。不过目前还存在一些问题,比如虽然明确了 H2AS40Gc 在 TNBC 中的重要作用,但它的修饰水平是如何被调控的还不清楚,而且研究仅基于细胞系,缺乏患者样本的验证。未来需要进一步探索 H2AS40Gc 修饰的调控机制,开展更多临床研究,验证其在患者体内的作用,从而推动 TNBC 治疗新策略的开发,为攻克这一难治性癌症带来新的希望。