《Trials》:The gut microbiota and diabetic nephropathy: an observational study review and bidirectional Mendelian randomization study
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该综述通过观察性研究和孟德尔随机化分析,探讨肠道微生物群(GM)与糖尿病肾病(DN)关系,为 DN 诊疗提供新视角。
肠道微生物群与糖尿病肾病关系的研究进展
糖尿病作为一种日益普遍的全球性健康问题,预计在未来十年内将影响超过 5.78 亿人。糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)作为糖尿病常见的微血管并发症,其发病机制复杂,涉及遗传、免疫、炎症损伤、应激反应以及糖脂代谢紊乱等多种因素。尽管针对这些机制的治疗策略不断涌现,但 DN 仍然给全球公共卫生系统带来沉重负担,现有治疗方法存在局限性。与此同时,个体对 DN 的易感性差异显著,其确切原因尚不清楚,且除了已知的代谢因素外,其他潜在影响因素也有待探索。
在这样的背景下,肠道微生物群(Gut Microbiota,GM)逐渐成为研究热点。GM 作为人体肠道内复杂的微生物生态系统,对人体免疫和代谢具有重要意义。多项研究表明,GM 的变化与多种疾病相关,包括炎症、代谢紊乱、精神疾病和免疫功能障碍等。在肾脏疾病领域,GM 也被证实与慢性肾脏病(CKD)存在关联,然而其与 DN 之间的具体关系尚不明确。
研究目的与方法
本研究旨在全面剖析 GM 与 DN 之间的关系。一方面,通过回顾观察性研究,比较 DN 患者和对照组 GM 的差异,从门、纲、目、科、属、种等不同分类层次进行深入分析;另一方面,运用孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)方法,利用全基因组关联研究(Genome Wide Association Study,GWAS)数据,探究 GM 对 DN 易感性的因果影响,并通过反向 MR 分析进一步验证两者关系。
在研究过程中,首先进行文献检索,筛选出符合条件的观察性研究。检索范围涵盖从最早记录至 2024 年 3 月 6 日的相关文献,检索词包括 “intestinal microbiome”“gastrointestinal microbiota”“microbiome of the gut”“microbiota”“intestinal flora”“diabetic nephropathy”“diabetes-related kidney disease” 等,并运用逻辑运算符进行组合检索。经过严格筛选,最终纳入 11 项研究,这些研究需满足对比 DN 患者和非糖尿病个体 GM 变化、提供关键研究信息、使用粪便样本检测 GM 以及清晰描述 GM 鉴定技术等条件,同时排除缺乏特定细菌分类数据、会议报告、综述、系统分析、病例报告和原始数据的研究。
对于纳入研究的数据,收集包括第一作者、发表年份、诊断标准、国家、研究计划、年龄范围、样本量、GM 分析方法和相关发现等信息,并进行质量评估。运用 RoBANS 工具评估非随机研究的偏倚风险,从六个方面考量研究的方法学质量和潜在偏倚。
在 MR 分析方面,使用两样本 MR 评估不同转基因分类群与 DN 的关系。数据来源于 GM 和 DN 的 GWAS,为确保结果可靠,MR 分析需满足三个关键假设:一是保证 GM 与最终使用的工具变量(Instrumental Variable,IV)紧密相关;二是纳入的 IV 与影响 GM 和 DN 的混杂因素相互独立;三是避免水平多效性,即 IV 仅通过转基因分类群影响 DN。通过严格筛选,确定与 211 个 GM 分类群相关的 IV,并利用 R 软件进行统计分析,运用 “TwoSampleMR” 和 “MR-PRESSO” 等软件包,设置统计学显著性阈值为 P<0.05,并采用 Bonferroni 校正进一步严格解释因果关系。
研究结果
11 项观察性研究结果显示,DN 患者和对照组之间 GM 的丰度存在显著差异,共涉及 144 个 GM 分类群。在门水平上,Bacteroidetes、Proteobacteria、Actinobacteria 和 Fusobacteria 在 DN 患者中显著增加,而 Cyanobacteria 和 Firmicutes 则减少;在纲、目、科、属和种水平上也观察到多种细菌的变化,但不同研究之间存在一定差异。
MR 分析结果表明,在调整后,Proteobacteria 门和 Dialister 属对 DN 具有保护作用,而 Akkermansia 属、Verrucomicrobiaceae 科、Verrucomicrobia 目和 Verrucomicrobiae 纲则增加了 DN 的发病风险。敏感性分析显示,这些结果具有较好的稳定性,未检测到明显的异质性和水平多效性。
反向 MR 分析未发现 DN 与 GM 之间存在显著的因果关系。
研究结论与意义
本研究通过观察性研究和 MR 分析,验证了特定 GM 分类群与 DN 之间的因果关系,为理解 DN 的发病机制提供了新的视角。这些发现有助于探索 GM 作为 DN 潜在生物标志物的可能性,为开发针对性的预防和治疗策略奠定基础。
GM 的变化不仅与 DN 的发生发展密切相关,还可能影响脂质和葡萄糖代谢、炎症反应以及免疫功能。例如,Proteobacteria 门在保护肾脏功能方面的作用存在争议,不同研究结果差异可能源于研究对象(人和小鼠)、分析层面(属水平包含众多分类群,相互作用复杂)以及疾病阶段的不同。Dialister 属代谢碳水化合物产生的乙酸和丁酸等物质,可能对肾脏功能具有保护作用;而 Lachnospiraceae_UCG_008 则可能通过增强炎症反应影响肾脏功能。
在临床应用方面,GM 的变化有望成为 DN 诊断的重要指标。已有研究表明,DN 患者、2 型糖尿病(T2DM)患者和健康人群的粪便细菌存在显著差异,这为基于 GM 的诊断提供了依据。此外,基于 GM 的治疗方法,如粪菌移植(FMT)和益生菌干预,在动物实验中已显示出改善 DN 的潜力,为 DN 的治疗开辟了新途径。
然而,本研究也存在一定局限性。观察性研究的异质性导致难以充分调整潜在混杂因素,部分研究的样本代表性有限,且 MR 分析中 SNP 选择可能存在偏倚,研究结果可能无法推广至其他人群。未来研究需要进一步扩大样本量,深入探索 GM 与 DN 在物种水平的关系,为研究肠道 - 肾脏轴提供更有力的临床证据。
综上所述,本研究对 GM 与 DN 关系的深入探讨,为 DN 的防治提供了新的思路和方向,尽管目前仍存在诸多挑战,但随着研究的不断深入,有望为 DN 患者带来更有效的治疗方法。
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