全外显子测序助力遗传性支气管扩张精准诊断:开启罕见病诊疗新篇章

《Orphanet Journal of Rare Diseases》:Whole exome sequencing enhances diagnosis of hereditary bronchiectasis

【字体: 时间:2025年03月25日 来源:Orphanet Journal of Rare Diseases 3.4

编辑推荐:

  为解决遗传性支气管扩张诊断难题,北京协和医院研究人员开展全外显子测序(WES)研究,发现 WES 可提升诊断率,对临床诊断意义重大。

  

# 全外显子测序为遗传性支气管扩张诊断带来新曙光
在呼吸疾病的领域中,支气管扩张是一种较为复杂的疾病,就像一把隐藏在呼吸道深处的 “暗箭”,时刻威胁着人们的健康。它表现为气道永久性扩张,背后的成因多种多样,有感染、遗传、免疫等因素,然而大部分病例的病因却如同迷雾一般,难以捉摸,被归为特发性支气管扩张。其中,遗传性支气管扩张更是一个特殊的 “小众群体”,它由基因突变引发,像囊性纤维化(CF)、原发性纤毛运动障碍(PCD)、α-1 抗胰蛋白酶缺乏症以及免疫缺陷等疾病都与之相关 。

以往,想要精准识别出遗传性支气管扩张这个 “隐藏的敌人” 并非易事。一方面,它的发病率相对较低,在成人支气管扩张患者中,CF、PCD 和免疫缺陷分别仅占 0.6 - 2.7%、0.9 - 10.3% 和 5% ,在亚洲人群中 CF 更是罕见,这使得临床医生对它的了解和重视程度不足。另一方面,它的诊断过程复杂又艰难,需要进行多种检测,如 CF 诊断要做汗液氯化物检测和囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)突变分析,PCD 诊断则涉及基因检测、鼻一氧化氮(nNO)测量和透射电子显微镜(TEM)分析等,而且不同人群的致病基因谱存在差异,传统基因检测方法难以全面覆盖,这些都为诊断工作设置了重重障碍。


为了突破这些困境,北京协和医院的研究人员挺身而出,开展了一项极具意义的研究。他们以 87 位具有遗传性支气管扩张临床特征(如弥漫性支气管扩张累及≥2 个肺叶、童年起病、反复中耳炎、鼻窦炎、器官偏侧性缺陷或有支气管扩张家族史)的患者为研究对象,运用全外显子测序(WES)技术,并结合体格检查、汗液氯化物检测、nNO 测量、TEM 分析等非基因检测方法,对遗传性支气管扩张的诊断展开深入探索。


研究人员所运用的关键技术方法主要有:样本均来自北京协和医院呼吸与危重症医学科的门诊及住院患者;通过 WES 对采集自外周血的样本进行分析;利用汗液氯化物检测、nNO 测量、TEM 分析等辅助诊断;针对基因检测阴性患者的原始数据,采用特定软件重新分析。


研究结果如下:


  1. 患者基本情况:87 位患者中男性 32 人(36.8%),女性 55 人(63.2%),平均年龄 29.8±12.9 岁,大部分(83.5%)为成年人。部分患者进行了汗液氯化物检测、nNO 测量、TEM 分析,结果发现 10 例 CF 阳性、2 例 PCD 相关的纤毛超微结构缺陷等123

  2. WES 检测结果:87 例患者 WES 检测后,36 例(41.4%)呈阳性,涉及 CFTR、DNAH5 等多个基因。重新分析 51 例初始检测阴性患者的原始数据后,又确诊 2 例,1 例为 CF,另 1 例疑似携带新的 PCD 致病基因456

  3. 诊断率提升:仅依靠非基因检测方法时,确诊 22 例(25.3%);结合 WES 后,确诊率提升至 47.1%(41/87);重新分析原始数据后,最终 43 例(49.4%)被确诊为遗传性支气管扩张,其中 CF 15 例(17.2%),PCD 27 例(31.0%),免疫缺陷 - 21 有 1 例(1.2%)768


研究结论与讨论部分指出,WES 显著提高了遗传性支气管扩张的诊断率,约半数患者最终确诊,高于普通支气管扩张患者中遗传性支气管扩张的比例,表明这类患者可能存在独特的临床特征。对于临床疑似遗传性支气管扩张的患者,建议采用 WES 结合其他非基因检测方法进行诊断;对于初始基因检测阴性的患者,重新分析 WES 数据可能会获得新的诊断结果。不过,该研究也存在一定的局限性,如存在选择偏倚、部分患者未完成全部非基因检测、重新分析依赖的文件注释可能存在问题、部分基因变异难以检测以及 WES 检测费用较高等。但总体而言,这项研究为遗传性支气管扩张的诊断指明了新方向,为临床医生提供了更有力的诊断工具,有望推动罕见病诊断领域的进一步发展,让更多患者受益。未来,随着技术的不断进步和研究的深入,相信在遗传性支气管扩张的诊断和治疗方面会取得更多突破 。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号